Isolation, identification et étude de l'activité antibactérienne des champignons endophytes de Coptis chinensis Franch. Coptis chinensis appartient à la famille des Ranunculaceae et au genre Coptis. Selon le Compendium of Materia Medica, Coptis chinensis a pour effet de dissiper la chaleur, d'assécher l'humidité, de purger le feu et de désintoxiquer. Il existe environ 18 espèces de plantes Huanglian, dont 6 sont produites en Chine, à savoir Huanglian, Sanjiaoyou Huanglian, Yunnan Huanglian, Emei Huanglian, Wuye Huanglian et Wujian Huanglian. Une variante est le Short sepal Huanglian, et les trois premiers sont communément appelés "Weilian", "Yalian" et "Yunlian". Le Sichuan est l'une des principales régions de production du Huanglian. Selon la "Biographie des médecins célèbres", "le Huanglian est né à Wuyang et dans les montagnes du comté de Shu, et était récolté en février et en août". Dès avant la dynastie Ming, le Huanglian a été cultivé artificiellement dans la région d'Emei, au Sichuan. Actuellement, il existe des bases de plantation de GAP Weilian dans la région d'Emei au Sichuan. La décoction de Huanglian, un remède traditionnel chinois, a des effets antibactériens in vitro significatifs sur Staphylococcus aureus, Escherichia coli et d'autres bactéries. Le mécanisme antibactérien du Huanglian et de ses ingrédients actifs est complexe et diversifié : il endommage les membranes des cellules bactériennes, inhibe la synthèse des macromolécules intracellulaires, bloque la division et le développement bactériens et interfère avec la formation de l'anneau Z pour inhiber la protéine de division cellulaire FtsZ.
Les bactéries endophytes sont des bactéries ou des champignons qui habitent les organes des plantes, peuvent s'installer dans les tissus internes des plantes et ne causent pas de dommages significatifs à l'hôte. Les bactéries endophytes sont de nouvelles sources importantes de produits bioactifs dans les plantes. Des chercheurs ont isolé le champignon endophyte Cytospora sp. de la pomme de pin Conocarpus erecta et ont recherché un nouveau composé antibactérien, Cytosporone D, dans son bouillon de fermentation. Ce composé a montré des effets antibactériens significatifs contre Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Escherichia coli et Candida albicans. La résistance aux antibiotiques, de plus en plus grave, constitue une menace importante pour la santé humaine, et l'exploration des ressources fongiques endophytiques des plantes médicinales est l'un des nouveaux moyens de rechercher de nouveaux antibiotiques.
Coptis chinensis étant l'une des principales régions productrices, les recherches sur la diversité des champignons endophytes de Coptis chinensis du Sichuan sont encore insuffisantes. En même temps, il n'y a pas de recherche sur l'activité antibactérienne et le mécanisme des métabolites des champignons endophytes de Coptis chinensis. À l'heure actuelle, les recherches sur les champignons endophytes de Coptis chinensis se sont concentrées sur l'isolement de composés monomères dans les métabolites des souches bactériennes et sur le dépistage des champignons endophytes de Coptis chinensis qui produisent de la berbérine. La poursuite des recherches sur la diversité des champignons endophytes des plantes médicinales et de leurs métabolites est très importante et précieuse. Par conséquent, en se basant sur les avantages géographiques du Sichuan Huanglian, cette étude explore la diversité des champignons endophytes du Sichuan Huanglian, étudie plus avant le mécanisme antibactérien de leurs métabolites et fournit une base pour l'application des ressources fongiques endophytiques dans le Huanglian.

 

Dans cette étude, 14 champignons endophytes, dont Paraboremia sp, ont été isolés des rhizomes, des tiges, des feuilles et des racines fibreuses des plantes de Coptis chinensis Ilyonectria sp.、Clonostachys sp.、Volutella sp.、Fusarium avenaceum、Cylidrocladiella sp.、Cercospora sp.、Dendryphion nanum、Phomatospora biseriata、Colletotrichum sp.、Didymellaceae sp.。 À l'exception des genres Ilyonectoria et Fusarium signalés dans la littérature, les 12 autres champignons endophytes n'ont pas été signalés. Par conséquent, cette étude enrichit considérablement la diversité des espèces de champignons endophytes de Coptis chinensis dans la région du Sichuan et jette de bonnes bases pour les recherches futures.
Le huanglian, médecine traditionnelle chinoise, a de bons effets antibactériens et anti-inflammatoires, mais il y a peu de recherches dans le domaine des bactéries endophytes. Cette étude a examiné l'inhibition de S Cop L01, une souche fongique endophyte de Coptis chinensis cultivée par Aureus, appartenant à Colletotrichum sp. En comparant la littérature nationale et étrangère, on constate que ce type de bactérie est une bactérie endophyte commune dans les plantes, y compris Artemisia annua, Dendrobium officinale, Taxus chinensis, et d'autres plantes, qui ont toutes été isolées. Parallèlement, de nombreuses études ont été menées sur l'activité antibactérienne des métabolites de ce champignon. Les métabolites de Colletotrichum sp., un champignon endophyte dans Artemisia annua, ont des effets antibactériens sur Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans et Aspergillus niger ; l'extrait de méthanol de Colletotrichum sp, un champignon endophyte de Huangjing, a montré une activité antibactérienne contre Staphylococcus aureus multirésistant avec une valeur MIC de 31 μ g/mL. En résumé, la souche Cop L01 obtenue dans cette étude mérite d'être étudiée plus avant. Il est nécessaire de mener des recherches plus approfondies sur la composition des métabolites de Cop L01 et sur la structure des composés apparentés. La littérature a également fait état de champignons endophytes de Cop produisant de la berbérine, ce qui peut permettre d'étudier plus avant si les champignons endophytes de Cop peuvent produire des métabolites secondaires identiques ou similaires à ceux de l'hôte, ou l'émergence de nouvelles substances actives. Les champignons endophytes constituent un grand trésor de substances actives naturelles, et les chercheurs devraient développer et utiliser cette ressource de manière exhaustive et approfondie.