Étude des métabolites secondaires de Streptomyces sp. CPCC 203679, originaire du sol
Les actinobactéries constituent une ressource importante pour la découverte de nouveaux antibiotiques, car elles peuvent produire une variété de produits naturels actifs avec divers types de structure. Streptomyces est le genre dominant des actinomycètes, avec le plus grand nombre d'espèces efficaces rapportées. Il est largement répandu dans le sol, l'eau douce, les environnements marins et certains organismes. Streptomyces est connu pour produire une grande variété de métabolites secondaires actifs avec divers types de structure, et est une source importante d'antibiotiques couramment utilisés dans la pratique clinique. Actuellement, environ deux tiers des antibiotiques utilisés en pratique clinique sont produits par ce genre de micro-organismes. Ces dernières années, un grand nombre de métabolites secondaires structurellement nouveaux et biologiquement actifs ont été continuellement signalés dans le genre Streptomyces, ce qui indique que la découverte de nouveaux composés principaux à partir de ce genre a encore un grand potentiel. Notre groupe de recherche a découvert une souche de Streptomyces sp. CPCC 203679 dérivée du sol au cours du criblage préliminaire de l'activité biologique. L'extrait brut de son bouillon de fermentation présente une bonne activité antibactérienne. Dans cette étude, diverses techniques modernes de chromatographie et de spectroscopie ont été utilisées pour isoler, purifier et identifier structurellement les métabolites secondaires de la souche, et 9 composés ont été obtenus (voir figure 1). Les composés 1-8 ont été évalués pour leurs activités antibactériennes et cytotoxiques in vitro.

 

Neuf composés ont été isolés du bouillon de fermentation de Streptomyces sp. CPCC 203679 provenant du sol, y compris des acides gras, des alcaloïdes et des dipeptides cycliques. Le composé 1 est un nouveau composé d'acide gras, et le composé 3 a été isolé pour la première fois à partir de Streptomyces provenant du sol. Les résultats de l'évaluation de l'activité pharmacologique ont montré que les composés 1 à 8 ne présentaient pas d'activité antibactérienne et antitumorale significative. Le composé 2 appartient à la classe des alcaloïdes et est largement présent dans les micro-organismes tels que les actinomycètes, les bactéries et les champignons, comme Streptomyces Bacillus、Aspergillus、Alternaria。 Le composé 3 appartient à la classe des alcaloïdes indoliques et a été signalé pour la première fois en 1965. Ce composé a également été signalé dans des genres tels que Bacillus, Balansia, Edwardsiella, etc. Selon les rapports de la littérature, le composé 3 a des effets anti-pollution et un certain effet inhibiteur sur les larves de balanes. Sa valeur ED50 est de 18,6 μ mol/L. Les dipeptides cycliques sont les plus petits peptides cycliques dans la nature, largement présents dans les produits métaboliques des plantes, des animaux et des micro-organismes, avec des activités telles que les propriétés antibactériennes, antitumorales, neuroprotectrices et antithrombotiques. Cette étude n'a pas permis d'isoler des métabolites secondaires ayant une activité biologique significative, ce qui peut être dû au fait que les groupes de gènes biosynthétiques des métabolites actifs n'ont pas été activés dans les conditions de culture actuelles, ou qu'ils n'ont pas été isolés en raison d'une faible production de métabolites actifs. À l'avenir, nous tenterons d'optimiser les conditions de culture afin d'accroître la diversité structurelle des métabolites secondaires et de combiner davantage l'évaluation de l'activité antibactérienne afin d'obtenir des métabolites secondaires structurellement nouveaux et significativement actifs.