Helicobacter pylori ile ili\u015fkili peptik \u00fclserlerin tedavisi i\u00e7in Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n \u00e7ekirdek genleri ve anahtar mikroRNA taramas\u0131 \u00fczerine ara\u015ft\u0131rma
\nPeptik \u00fclser (P\u00dc), mide ve duodenumda ortaya \u00e7\u0131kma e\u011filiminde olan, klinik pratikte en s\u0131k g\u00f6r\u00fclen sindirim sistemi hastal\u0131klar\u0131ndan biridir. P\u00dc'n\u00fcn g\u00f6r\u00fclme oran\u0131 farkl\u0131 \u00fclke ve b\u00f6lgelere g\u00f6re de\u011fi\u015fmektedir. Ara\u015ft\u0131rmalar, d\u00fcnyadaki insanlar\u0131n yakla\u015f\u0131k 5%~10%'sinin ya\u015famlar\u0131 boyunca peptik \u00fclserden muzdarip oldu\u011funu g\u00f6stermektedir. Klinik veriler, peptik \u00fclser hastal\u0131\u011f\u0131 olan hastalar\u0131n \u00c7in'deki gastroskopi vakalar\u0131n\u0131n 10.3% ila 32.6%'sini olu\u015fturdu\u011funu g\u00f6stermektedir. \u00c7o\u011fu PU hastas\u0131n\u0131n tipik semptomu, \u00fcst ve orta kar\u0131n b\u00f6lgesinde tekrarlayan ritmik a\u011fr\u0131d\u0131r; Baz\u0131 hastalar\u0131n semptomlar\u0131nda spesifiklik yoktur, \u00fcst abdominal distansiyon, anoreksi ve asit refl\u00fc gibi gastrointestinal semptomlar olarak kendini g\u00f6sterir; Az say\u0131da hastada ana semptom olarak gastrointestinal kanama ve perforasyon gibi PU komplikasyonlar\u0131 vard\u0131r. \u00c7in'in ekonomik seviyesinin b\u00fcy\u00fcmesi, insanlar\u0131n ya\u015fam kalitesinin iyile\u015fmesi ve \u00e7al\u0131\u015fma temposunun h\u0131zlanmas\u0131yla birlikte, PU'nun g\u00f6r\u00fclme oran\u0131 gittik\u00e7e artmakta ve bu da hastalar\u0131n fiziksel ve zihinsel sa\u011fl\u0131\u011f\u0131 ve ya\u015fam kalitesi \u00fczerinde ciddi bir etkiye sahip olmaktad\u0131r.<\/p>\n
Avustralyal\u0131 bilim insanlar\u0131 Warren ve Marshall'\u0131n 1983 y\u0131l\u0131nda hastalar\u0131n gastrik mukozal biyopsi \u00f6rneklerinden Helicobacter pylori'yi (Hp) izole etmelerinden bu yana, Hp'nin P\u00dc'n\u00fcn olu\u015fumu, geli\u015fimi ve n\u00fcks\u00fc ile yak\u0131ndan ili\u015fkili oldu\u011fu do\u011frulanm\u0131\u015ft\u0131r. Hp enfeksiyonunun neden oldu\u011fu peptik \u00fclserler Hp ile ili\u015fkili PU olarak da bilinir. Antibiyotik antibakteriyel tedavi ve proton pompas\u0131 inhibit\u00f6r\u00fc asit bask\u0131lama tedavisinin kombinasyonu \u015fu anda Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde temel y\u00f6ntemdir. Ancak antibiyotiklerin yayg\u0131n kullan\u0131m\u0131yla birlikte, \u00c7in'de Hp'nin klaritromisin, metronidazol ve levofloksasine kar\u015f\u0131 diren\u00e7 oran\u0131 y\u0131ldan y\u0131la artmakta, bu da \u00fc\u00e7l\u00fc tedavinin Hp'yi ortadan kald\u0131rmada azalmas\u0131na veya hatta ba\u015far\u0131s\u0131z olmas\u0131na yol a\u00e7maktad\u0131r. \u015eu anda, \u00c7in'de Hp ile ili\u015fkili PU i\u00e7in tercih edilen tedavi, 10 veya 14 g\u00fcnl\u00fck bir k\u00fcr ile bizmut d\u00f6rtl\u00fc tedavisidir. Bu y\u00f6ntemin de artan antibiyotik direnci, y\u00fcksek advers reaksiyonlar, d\u00fc\u015f\u00fck hasta uyumu ve a\u011f\u0131r ekonomik y\u00fck gibi sorunlar\u0131 vard\u0131r. Bu nedenle, Hp ile ili\u015fkili PU i\u00e7in tedavi plan\u0131n\u0131 geni\u015fletmek i\u00e7in geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131 tedavisinin uygulanmas\u0131 gastroenteroloji ara\u015ft\u0131rmalar\u0131ndaki s\u0131cak noktalardan biridir.<\/p>\n
Geleneksel \u00c7in T\u0131bb\u0131, Hp ile ili\u015fkili PU'nun \"epigastrik a\u011fr\u0131\", \"asit yutma\", \"g\u00fcr\u00fclt\u00fc\" vb. kategoriler alt\u0131nda s\u0131n\u0131fland\u0131r\u0131labilece\u011fine inanmaktad\u0131r. Temel patogenez, patojenik toksinlerin istilas\u0131, pozitif ve negatif enerji eksikli\u011fi ve qi hareketinin dengesizli\u011fidir. Hp \"k\u00f6t\u00fc qi\" kategorisine aittir ve genellikle \u0131s\u0131 ve toksisite gibi patolojik \u00f6zelliklere sahiptir. Hp'nin neden oldu\u011fu \u00fclserler genellikle nemli \u0131s\u0131 sendromu olarak kendini g\u00f6sterir. Is\u0131n\u0131n temizlenmesi, rutubetin giderilmesi ve detoksifikasyon y\u00f6ntemi, Hp ile ili\u015fkili PU i\u00e7in \u00f6nemli tedavi y\u00f6ntemlerinden biridir. Coptis chinensis Franch, Ranunculaceae familyas\u0131ndan bir bitkidir (Weilian olarak da bilinir), Sanjiaoye Huanglian C Deltoidea C.Y. Cheng et Hsiao (Yalian olarak da bilinir) veya Yunlian C Teeta Wall'un kuru rizomlar\u0131 do\u011fas\u0131 gere\u011fi so\u011fuk ve tad\u0131 ac\u0131d\u0131r. Kalp, dalak, mide ve kal\u0131n ba\u011f\u0131rsak meridyenlerinde bulunurlar ve \u0131s\u0131y\u0131 temizleme, nemi kurutma, ate\u015fi bo\u015faltma ve detoksifiye etme etkilerine sahiptirler. Scutellaria baicalensis Georgi, Lamiaceae familyas\u0131na ait bir bitki olan Scutellaria baicalensis Georgi'nin kurutulmu\u015f k\u00f6k\u00fcd\u00fcr. So\u011fuk bir yap\u0131ya ve ac\u0131 bir tada sahiptir ve akci\u011ferler, safra kesesi, dalak, kal\u0131n ba\u011f\u0131rsak ve ince ba\u011f\u0131rsak meridyenlerinde bulunur. Is\u0131 ve nemi temizleme, ate\u015fi bo\u015faltma ve detoksifiye etme, kan\u0131 so\u011futma ve kanamay\u0131 durdurma etkilerine sahiptir. Scutellaria Radix Coptidis Rhizoma'dan (SRCR) olu\u015fan t\u0131bbi \u00e7ift, geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131ndaki klasik \u0131s\u0131 temizleyici ve detoksifiye edici ila\u00e7lardan biridir. Bu ikili genellikle Hp ile ili\u015fkili PU'yi tedavi etmek i\u00e7in kombinasyon halinde kullan\u0131l\u0131r ve kesin klinik etkinli\u011fe sahiptir. Bununla birlikte, mevcut raporlar, aktif bile\u015fenlerinin molek\u00fcler a\u011f d\u00fczenleme mekanizmalar\u0131, hedefleri, sinyal yollar\u0131 vb. hakk\u0131nda sistematik ve kapsaml\u0131 bir \u00e7al\u0131\u015fmadan yoksundur.<\/p>\n
A\u011f farmakolojisi, biyoinformatik, sistem biyolojisi ve bilgisayar a\u011f\u0131 analiz teknolojisi gibi birden fazla disiplinden teorileri entegre eden yeni bir ila\u00e7 ara\u015ft\u0131rma modelidir. \u0130la\u00e7lar ve hastal\u0131klar aras\u0131ndaki ili\u015fkiyi genel biyolojik a\u011f homeostaz\u0131 perspektifinden ke\u015ffedebilir. A\u011f farmakolojisinin sundu\u011fu b\u00fct\u00fcnsel ve sistematik \u00f6zellikler, TCM b\u00fct\u00fcnsel bak\u0131\u015f a\u00e7\u0131s\u0131, sendrom farkl\u0131la\u015fmas\u0131 ve tedavisi ve TCM uyumlulu\u011fu ilkeleriyle \u00f6rt\u00fc\u015fmektedir. Bu \u00e7al\u0131\u015fmada, Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n \u00e7ok bile\u015fenli, \u00e7ok hedefli ve \u00e7ok yollu \u00f6zelliklerini analiz etmek i\u00e7in a\u011f farmakolojisi ve biyoinformatik y\u00f6ntemleri kullan\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r. \u00c7ekirdek genlere ve anahtar mikroRNA'lara dayanarak, Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde molek\u00fcler a\u011f d\u00fczenleme mekanizmas\u0131 ara\u015ft\u0131r\u0131lm\u0131\u015f, Hp ile ili\u015fkili PU'nun klinik tedavisi i\u00e7in bilimsel temel sa\u011flamak ve sonraki derinlemesine deneysel ara\u015ft\u0131rmalar i\u00e7in fikir ve referanslar sa\u011flamak ama\u00e7lanm\u0131\u015ft\u0131r.<\/p>\n
\u0130lk olarak, SRCR'nin ana aktif bile\u015fenleri ve potansiyel hedefleri Geleneksel \u00c7in T\u0131bb\u0131 Sistemleri Farmakoloji Veritaban\u0131 ve Analiz Platformu (TCMSP) arac\u0131l\u0131\u011f\u0131yla elde edilmi\u015ftir; GEO veritaban\u0131ndan GSE70394 gen ekspresyon profili verilerini elde edin, Hp ile enfekte insan mide epitel h\u00fccrelerinde (GES) yer alan diferansiyel olarak ifade edilen genlerin (DEG'ler) \u00e7ip verilerini homojenize etmek i\u00e7in R yaz\u0131l\u0131m\u0131n\u0131 kullan\u0131n ve DEG volkan\u0131n\u0131 ve k\u00fcme \u0131s\u0131 haritalar\u0131n\u0131 \u00e7izin; STRING veri taban\u0131n\u0131 kullanarak SRCR bile\u015fen hedefleri ile Hp ile enfekte insan GES h\u00fccresi DEG'leri aras\u0131nda bir protein etkile\u015fim a\u011f\u0131 olu\u015fturmak; DAVID veri taban\u0131n\u0131 kullanarak yukar\u0131da belirtilen karakteristik genler \u00fczerinde GO fonksiyonel ve KEGG yol zenginle\u015ftirme analizi ger\u00e7ekle\u015ftirmek; Daha sonra, Hp ile ilgili PU'nin SRCR tedavisinde yer alan \u00e7ekirdek genleri taramak i\u00e7in Cytohuba kullan\u0131ld\u0131; Target Scan ve miRBase veri tabanlar\u0131n\u0131 kullanarak \u00e7ekirdek genleri d\u00fczenleyen anahtar mikroRNA'lar\u0131n tahmini.<\/p>\n
Peptik \u00fclser, \u00e7e\u015fitli patojenik fakt\u00f6rlerin etkisi alt\u0131nda mukozan\u0131n enflamatuar reaksiyonlar\u0131 ve nekrotik lezyonlar\u0131 ile karakterize bir hastal\u0131kt\u0131r. Lezyonlar mukozal kas tabakas\u0131na n\u00fcfuz edebilir veya mide ve duodenum mukozas\u0131 en yayg\u0131n olmak \u00fczere daha derin seviyelere ula\u015fabilir. Hp'nin ke\u015ffinden bu yana, \u00e7ok say\u0131da \u00e7al\u0131\u015fma Hp'nin peptik \u00fclserlerin ba\u015flamas\u0131na ve tekrarlamas\u0131na yol a\u00e7an en \u00f6nemli fakt\u00f6r oldu\u011funu do\u011frulam\u0131\u015ft\u0131r. Hp ile ili\u015fkili P\u00dc, Hp enfeksiyonu ile yak\u0131ndan ili\u015fkili olan P\u00dc'n\u00fcn olu\u015fumu, geli\u015fimi, prognozu ve n\u00fcks\u00fcn\u00fc ifade eder. Hp enfeksiyonunun neden oldu\u011fu peptik \u00fclserin patojenik mekanizmas\u0131 \u00e7ok karma\u015f\u0131kt\u0131r ve gastroenteroloji klinik \u00e7al\u0131\u015fanlar\u0131 i\u00e7in uzun s\u00fcreli bir ara\u015ft\u0131rma konusu olmu\u015ftur. \u015eu anda, ilgili d\u00f6rt ana teori vard\u0131r: \u2460 s\u0131zd\u0131ran \u00e7at\u0131 teorisi; \u2461 Gastrin mide asidi ile ilgili teori; \u2462 Gastrik metaplazi teorisi; \u2463 Medya y\u0131kama teorisi. Klinik uygulamada, Helicobacter pylori'yi inhibe etmek veya \u00f6ld\u00fcrmek, gastrik asidi azaltmak ve gastrik mukozay\u0131 korumak, b\u00f6ylece Hp ile ili\u015fkili PU'yu tedavi etmek i\u00e7in \u00fc\u00e7l\u00fc veya d\u00f6rtl\u00fc tedavi yayg\u0131n olarak kullan\u0131lmaktad\u0131r. Antibiyotiklerin uzun s\u00fcreli irrasyonel kullan\u0131m\u0131 nedeniyle, Hp direnci her ge\u00e7en y\u0131l artmakta, bu da \u00fc\u00e7l\u00fc veya d\u00f6rtl\u00fc tedavinin k\u00fcr oran\u0131nda bir d\u00fc\u015f\u00fc\u015fe veya hatta ba\u015far\u0131s\u0131zl\u0131\u011fa yol a\u00e7maktad\u0131r. Buna ek olarak, Hp eradikasyon programlar\u0131n\u0131n normal gastrointestinal mikrobiyota \u00fczerindeki etkisi, \u00f6rne\u011fin mikrobiyotan\u0131n disbiyozuna veya ince ba\u011f\u0131rsak bakterilerinin a\u015f\u0131r\u0131 b\u00fcy\u00fcmesine neden olmas\u0131 da yayg\u0131n ilgi g\u00f6rm\u00fc\u015ft\u00fcr. Bu nedenle, Hp direnci sorununu \u00e7\u00f6zmek, antibiyotiklerin gastrointestinal etkilerini ve di\u011fer yan etkilerini azaltmak ve \u00fclserlerin n\u00fcks oran\u0131n\u0131 kontrol etmek i\u00e7in geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131 kapsaml\u0131 tedavisinin se\u00e7ilmesi \u00f6nemli klinik \u00f6neme sahiptir.<\/p>\n
Geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131nda \"Hp ile ili\u015fkili PU\" ad\u0131 alt\u0131nda bir hastal\u0131k kayd\u0131 bulunmamaktad\u0131r. Modern doktorlar ana klinik semptomlara dayanarak \"epigastrik a\u011fr\u0131\", \"asit yutma\", \"g\u00fcr\u00fclt\u00fc\" ve di\u011fer kategoriler olarak s\u0131n\u0131fland\u0131rmaktad\u0131r. Geleneksel \u00c7in T\u0131bb\u0131, epigastrik a\u011fr\u0131n\u0131n ba\u015fl\u0131ca mideyi istila eden d\u0131\u015f patojenler, duygusal bozukluklar, d\u00fczensiz beslenme ve uzun s\u00fcreli fiziksel zay\u0131fl\u0131k gibi bir\u00e7ok nedeni oldu\u011funa inanmaktad\u0131r. Hp enfeksiyonu eksojen patojenik qi kategorisine aittir ve Hp ile ili\u015fkili PU genellikle termal ve toksik \u00f6zelliklere sahiptir. Dalak ve mide zay\u0131f oldu\u011funda ve v\u00fccudun ya\u015famsal enerjisi yetersiz oldu\u011funda, Hp bu eksiklikten faydalanarak gastrointestinal sistemi istila eder, dalak ve mide fonksiyonlar\u0131nda uyumsuzlu\u011fa, qi hareketinde dengesizli\u011fe ve qi durgunlu\u011fu ve nemli \u0131s\u0131 gibi \u00e7e\u015fitli patolojik \u00fcr\u00fcnlerin olu\u015fumuna neden olarak mukozaya zarar verir, kaslar\u0131 \u00e7\u00fcr\u00fct\u00fcr ve \u00fclsere neden olur. \"\u00c7e\u015fitli Hastal\u0131klar\u0131n K\u00f6keni ve Kayna\u011f\u0131 \"nda belirtildi\u011fi gibi: Gergedan Mumu - Mide Hastal\u0131klar\u0131\": \"Mide a\u011fr\u0131s\u0131 epigastrik b\u00f6lgedeki patojenik kuruluktan kaynaklan\u0131r. Mide, bol miktarda qi ve kan ile uyumu te\u015fvik eden qi ile doludur. Mide g\u00fc\u00e7l\u00fc oldu\u011funda k\u00f6t\u00fcl\u00fck kurutulamaz, zay\u0131f oldu\u011funda ise hastal\u0131\u011fa d\u00f6n\u00fc\u015f\u00fcr. Durgun su ve yiyeceklerle so\u011fuk ve s\u0131cak olma e\u011filimindedir, bunlar\u0131n hepsi ger\u00e7ek qi ile m\u00fccadele nedeniyle ac\u0131 vericidir. \u00c7ok say\u0131da klinik ara\u015ft\u0131rma sonucu, Hp ile ili\u015fkili PU'nun dalak mide nemli \u0131s\u0131 sendromunda daha yayg\u0131n oldu\u011funu ve \u0131s\u0131y\u0131 temizleme ve nemi ortadan kald\u0131rma tedavisinin bu hastal\u0131\u011f\u0131n tedavisi i\u00e7in \u00f6nemli bir yol g\u00f6sterici \u00f6neme sahip oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. Huangqin ve Huanglian kombinasyonu, \u0131s\u0131y\u0131 temizlemek, rutubeti gidermek ve toksinleri detoksifiye etmek i\u00e7in klasik bir klinik form\u00fcld\u00fcr. Her ikisi de ac\u0131 so\u011fuk ve \u0131s\u0131 giderici \u00fcr\u00fcnler kategorisine aittir ve \u0131s\u0131y\u0131 giderme, rutubeti kurutma, ate\u015fi giderme, detoksifikasyon, kan\u0131 so\u011futma ve kanamay\u0131 durdurma etkilerine sahip olmak i\u00e7in birlikte kullan\u0131lmal\u0131d\u0131r. Huangqin ve Huanglian kombinasyonu ayn\u0131 zamanda Banxia Xiexin Tang, Huanglian Jiedu Tang, Sanhuang Xiexin Tang gibi Hp ile ilgili PU tedavisinde yayg\u0131n olarak kullan\u0131lan form\u00fcllerde temel bir ila\u00e7 \u00e7iftidir. Modern farmakolojik ara\u015ft\u0131rmalar, hem Scutellaria baicalensis hem de Polygonatum sibiricum'un Hp \u00fczerinde olduk\u00e7a antibakteriyel etkilerinin yan\u0131 s\u0131ra antioksidan, anti-enflamatuar, antipiretik, hipoglisemik, anti-t\u00fcm\u00f6r, mide mukozas\u0131n\u0131 koruyucu ve ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k d\u00fczenleme etkilerine sahip oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. \u0130ki geleneksel \u00c7in ilac\u0131 olan Huangqin ve Huanglian benzer etkinlik ve farmakolojik etkilere sahiptir. Kombinasyonlar\u0131 genellikle sinerjik bir etkiye sahiptir ve Hp ile ili\u015fkili PU'nun klinik tedavisinde yayg\u0131n olarak kullan\u0131lmaktad\u0131r.<\/p>\n
Bu \u00e7al\u0131\u015fma, Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n ana molek\u00fcler a\u011f d\u00fczenleme mekanizmalar\u0131n\u0131 ke\u015ffetmek ve farmakolojik etkilerinde rol oynayabilecek \u00e7ekirdek genleri ve anahtar mikroRNA'lar\u0131 ara\u015ft\u0131rmak i\u00e7in a\u011f farmakolojisi ve biyoinformati\u011fe dayanmaktad\u0131r. TCMSP veri taban\u0131nda, Huangqin Huanglian t\u0131bbi \u00e7iftlerinin 41 aktif bile\u015feni nihayet taranm\u0131\u015ft\u0131r; bunlar aras\u0131nda Huanglian esas olarak alkaloidlerden ve Huangqin esas olarak flavonoidlerden olu\u015fmaktad\u0131r. Daha ileri ara\u015ft\u0131rmalar 216 potansiyel hedefi ve bile\u015fenler ile hedefler aras\u0131nda 764 etkile\u015fimi ortaya \u00e7\u0131karm\u0131\u015ft\u0131r. GEO veritaban\u0131 GSE70394 veri setinin i\u015flenmesi ve analiz edilmesiyle, Hp ile enfekte olmu\u015f insan gastrik mukozal epitel h\u00fccreleri ile normal gastrik mukozal epitel h\u00fccreleri aras\u0131nda 77 yukar\u0131 reg\u00fcle edilen gen ve 50 a\u015fa\u011f\u0131 reg\u00fcle edilen gen dahil olmak \u00fczere 127 \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde farkl\u0131 ifade edilen gen elde edilmi\u015ftir. STRING veri taban\u0131 ve Cytoscape yaz\u0131l\u0131m\u0131 kullan\u0131larak, Huangqin Huanglian ilac\u0131ndaki aktif bile\u015fen hedeflerinin PPI a\u011f\u0131 ve Hp ile enfekte insan mide epitel h\u00fccrelerinde \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde farkl\u0131 \u015fekilde ifade edilen genlerin PPI a\u011f\u0131 birle\u015ftirildi ve ikisinin kesi\u015fimi, Hp ile ilgili PU'yi tedavi etmek i\u00e7in Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n PPI a\u011f\u0131n\u0131 elde etmek i\u00e7in \u00e7\u0131kar\u0131ld\u0131. Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n bu hastal\u0131\u011f\u0131n aktif bile\u015fenlerle tedavisi \u00fczerindeki olas\u0131 etki mekanizmas\u0131n\u0131 daha fazla analiz etmek i\u00e7in, a\u011f\u0131ndaki 127 spesifik gen hedefi \u00fczerinde GO ve KEGG zenginle\u015ftirme analizi yapt\u0131k.<\/p>\n
GO ve KEGG zenginle\u015ftirme analizi sonu\u00e7lar\u0131 \u00e7oklu biyolojik s\u00fcre\u00e7leri ve \u00f6nemli sinyal yolaklar\u0131n\u0131 i\u00e7ermektedir. GO analizi sonu\u00e7lar\u0131 Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n sitokin yan\u0131t\u0131, protein kinaz aktivitesinin pozitif d\u00fczenlenmesi, enflamatuar yan\u0131t, ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k yan\u0131t\u0131, h\u00fccre proliferasyonunun negatif d\u00fczenlenmesi ve NF - \u03ba B transkripsiyon fakt\u00f6r\u00fc aktivitesinin pozitif d\u00fczenlenmesi gibi biyolojik s\u00fcre\u00e7lerde \u00f6nemli bir d\u00fczenleyici rol oynad\u0131\u011f\u0131n\u0131 g\u00f6stermi\u015ftir. Ve bu biyolojik s\u00fcre\u00e7ler, Huangqin Huanglian ilac\u0131 taraf\u0131ndan hedef genlerin d\u00fczenlenmesinde yer alan sinyal yollar\u0131na yans\u0131t\u0131labilir. KEGG analizi sonu\u00e7lar\u0131, 35 sinyal yolunun Hp ile ili\u015fkili PU'nun Huangqin Huanglian ilac\u0131 ile tedavisi ile yak\u0131ndan ili\u015fkili oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. \u00d6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde zenginle\u015ftirilmi\u015f sinyal yolaklar\u0131 aras\u0131nda sitokin sitokin resept\u00f6r etkile\u015fim yola\u011f\u0131, NOD benzeri resept\u00f6r sinyal yola\u011f\u0131, h\u00fccre yap\u0131\u015fma molek\u00fcl\u00fc yola\u011f\u0131, ErbB sinyal yola\u011f\u0131, NF - \u03ba B sinyal yola\u011f\u0131, Jak STAT sinyal yola\u011f\u0131 vb. bulunmaktad\u0131r.<\/p>\n
NOD benzeri resept\u00f6rler, sitoplazmada bulunan ve h\u00fccre i\u00e7i patojen enfeksiyonlar\u0131n\u0131n \u00f6nlenmesi ve tedavisinde b\u00fcy\u00fck \u00f6neme sahip olan ve do\u011fu\u015ftan gelen ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k yan\u0131tlar\u0131na kat\u0131lan kal\u0131p tan\u0131ma resept\u00f6rleridir. Hp h\u00fccre d\u0131\u015f\u0131 bir parazit olmas\u0131na ra\u011fmen, peptidoglikanlar\u0131 konak h\u00fccrelere aktarabilir ve NOD1 proteini ile temas etti\u011finde konak savunma yan\u0131tlar\u0131n\u0131 uyarabilir. Ara\u015ft\u0131rmalar, NOD1 protein eksikli\u011fi olan farelerin Hp'ye kar\u015f\u0131 daha duyarl\u0131 oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. NF - \u03ba B, Rel protein ailesine ait bir n\u00fckleer transkripsiyon fakt\u00f6r\u00fcd\u00fcr. Aktivasyondan sonra, \u00e7e\u015fitli genlerin transkripsiyonel ekspresyonunu d\u00fczenleyebilir ve v\u00fccutta inflamasyon, imm\u00fcn yan\u0131t, oksidatif stres, h\u00fccre proliferasyonu, farkl\u0131la\u015fma ve apoptoz gibi biyolojik s\u00fcre\u00e7lere yayg\u0131n olarak kat\u0131labilir. Baz\u0131 \u00e7al\u0131\u015fmalar, NF - \u03ba B sinyal yolunun aktivasyonunun Hp enfeksiyonunun belirte\u00e7lerinden biri oldu\u011funu ve ilgili enflamatuar hastal\u0131klar\u0131n ve kanserlerin geli\u015fiminde merkezi bir rol oynad\u0131\u011f\u0131n\u0131 g\u00f6stermektedir. Jak STAT sinyal yolu, NF - \u03ba B'nin aktivasyonuna ve Hp ile enfekte gastrik epitel h\u00fccrelerinde IL8'in ekspresyonuna arac\u0131l\u0131k eden sitokin uyar\u0131ml\u0131 bir sinyal yoludur. Buradan, \u00e7ok say\u0131da \u00e7al\u0131\u015fman\u0131n NOD benzeri resept\u00f6r sinyal yolu, NF - \u03ba B sinyal yolu ve Jak STAT sinyal yolu ile Hp enfeksiyonu aras\u0131ndaki yak\u0131n ili\u015fkiyi do\u011frulad\u0131\u011f\u0131 ve bu \u00e7al\u0131\u015fman\u0131n Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n Hp ile ilgili PU tedavisinde molek\u00fcler a\u011f d\u00fczenleme mekanizmas\u0131n\u0131 tahmin etmede belirli bir do\u011frulu\u011fa sahip oldu\u011funu g\u00f6sterdi\u011fi g\u00f6r\u00fclebilir.<\/p>\n
Sitokin sitokin resept\u00f6r\u00fc ile ilgili yol, h\u00fccre b\u00fcy\u00fcmesini ve farkl\u0131la\u015fmas\u0131n\u0131 d\u00fczenleyebilir, ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k tepkisini d\u00fczenleyebilir ve belirli ko\u015fullar alt\u0131nda iltihaplanma gibi \u00e7e\u015fitli hastal\u0131klar\u0131n olu\u015fumuna kat\u0131labilir. H\u00fccre adezyon molek\u00fcler yolu, h\u00fccre ba\u011flanmas\u0131 ve hareketinde rol oynar ve ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k tepkisi, enflamatuar tepki, p\u0131ht\u0131la\u015fma ve yara iyile\u015fmesi gibi fizyolojik ve patolojik s\u00fcre\u00e7lerin temelini olu\u015fturur. Sitokin resept\u00f6r\u00fc ile ilgili yolak ve h\u00fccre adezyon molek\u00fcl\u00fc yola\u011f\u0131 ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k fonksiyonu ile yak\u0131ndan ili\u015fkilidir, ancak \u015fu anda Hp enfeksiyonu ile ili\u015fkileri hakk\u0131nda \u00e7ok az rapor vard\u0131r ve bu da gelecekteki ara\u015ft\u0131rmalar i\u00e7in yeni fikirler sunmaktad\u0131r. Sinyal yollar\u0131 aras\u0131nda, kendi i\u015flevlerini geni\u015fletebilen ve karma\u015f\u0131k d\u00fczenleyici a\u011flar olu\u015fturabilen ara ba\u011flant\u0131lar ve kesi\u015fmeler vard\u0131r. Huangqin Huanglian ilac\u0131 sadece bu \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde zenginle\u015ftirilmi\u015f yolaklar \u00fczerinde de\u011fil, ayn\u0131 zamanda kanserle ilgili di\u011fer yolaklar \u00fczerinde de etki g\u00f6stererek Hp ile ilgili PU \u00fczerinde ortakla\u015fa terap\u00f6tik etkiler g\u00f6sterir.<\/p>\n
Cytohuba'n\u0131n MCC algoritmas\u0131, Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n PPI a\u011f\u0131n\u0131 analiz etmek i\u00e7in kullan\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r. Bu \u00e7al\u0131\u015fmada ilk 10 \u00e7ekirdek gen belirlenmi\u015ftir: CXCL8 IL10\u3001IL1B\u3001IL1R1\u3001TNFRSF1B\u3001IL6R\u3001IL10RA\u3001CD28\u3001VEGFA\u3001CD40LG\u3002 Bu \u00e7ekirdek genler genellikle enflamatuar ve imm\u00fcn yan\u0131tlarla ili\u015fkilidir. CXCL8, IL1B ve IL10 enflamatuar sitokinlerdir. IL8 olarak da bilinen CXCL8, n\u00f6trofilleri enflamasyon b\u00f6lgesine \u00e7ekebilen, ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k tepkilerini d\u00fczenleyen ve t\u00fcm\u00f6r proliferasyonu, g\u00f6\u00e7\u00fc ve istilas\u0131na kat\u0131labilen g\u00fc\u00e7l\u00fc bir pleiotropik sitokindir. Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar rekombinant Helicobacter pylori antijeni HP0986'y\u0131 gastrik epitel h\u00fccreleri ile birlikte k\u00fclt\u00fcre etmi\u015f ve HP0986'n\u0131n NF - \u03ba B yolu arac\u0131l\u0131\u011f\u0131yla doza ve zamana ba\u011fl\u0131 bir \u015fekilde gastrik epitel h\u00fccreleri taraf\u0131ndan IL8 salg\u0131lanmas\u0131n\u0131 ind\u00fckleyebilece\u011fini bulmu\u015flard\u0131r. IL1B, monositler\/makrofajlar taraf\u0131ndan salg\u0131lanan, T ve B lenfosit proliferasyonunu te\u015fvik eden ve n\u00f6trofilleri aktive eden \u00f6nemli bir enflamatuar arac\u0131d\u0131r. \u00c7al\u0131\u015fmalar, 10 ng\/mL IL1B'nin eksojen uygulamas\u0131n\u0131n h\u00fccre proliferasyonunu uyarabildi\u011fini, Helicobacter pylori ile ind\u00fcklenen apoptozu inhibe edebildi\u011fini ve H+- K+- ATPaz ekspresyonunu a\u015fa\u011f\u0131 reg\u00fcle ederek parietal h\u00fccre H+ salg\u0131s\u0131n\u0131 bask\u0131layabildi\u011fini bulmu\u015f ve IL1B'nin Hp ile ind\u00fcklenen mide kanserinde \u00f6nemli bir rol oynad\u0131\u011f\u0131n\u0131 d\u00fc\u015f\u00fcnd\u00fcrm\u00fc\u015ft\u00fcr. Ayr\u0131ca 21 \u00e7al\u0131\u015fman\u0131n geni\u015f \u00f6rneklemli bir meta-analizi, IL-1B-31C\/T gen polimorfizminin Hp enfeksiyonu riskini art\u0131rabilece\u011fini ve IL-1B-511-C\/T ve IL-8-251T\/A gen polimorfizmlerinin Hp ile ili\u015fkili \u00fclserler i\u00e7in risk fakt\u00f6rleri olabilece\u011fini g\u00f6stermektedir. IL10 bir anti-enflamatuar sitokindir ve klinik \u00e7al\u0131\u015fmalarda ekspresyonunun Hp pozitif peptik \u00fclserli ve gastritli hastalarda Hp negatif sa\u011fl\u0131kl\u0131 bireylere g\u00f6re anlaml\u0131 derecede y\u00fcksek oldu\u011fu bulunmu\u015ftur. IL10'un ekspresyon seviyesi, Hp enfeksiyonunun derecesi ve kronik inflamasyon geli\u015fimi ile pozitif korelasyon g\u00f6stermektedir.<\/p>\n
IL1R1, TNFRSF1B, IL6R ve IL10RA, IL1, TNF - \u03b1, IL6 ve IL10 gibi enflamatuar fakt\u00f6rlere ba\u011flanan sitokin resept\u00f6rleridir. Sitokinler, h\u00fccre i\u00e7i sinyal yollar\u0131n\u0131 ba\u015flatmak i\u00e7in ilgili resept\u00f6rlere ba\u011flanarak etkilerini g\u00f6sterirler. CD28, T h\u00fccreleri \u00fczerindeki ana ortak uyar\u0131c\u0131 resept\u00f6rd\u00fcr ve B7 ile ba\u011flanmas\u0131yla olu\u015fan ortak uyar\u0131c\u0131 sinyal, T h\u00fccresi aktivasyonunda \u00f6nemli bir rol oynar. CD40LG, B h\u00fccresi aktivasyonu i\u00e7in en \u00f6nemli ikinci haberci olarak CD40'a ba\u011flan\u0131r, B h\u00fccresi farkl\u0131la\u015fmas\u0131n\u0131 ve olgunla\u015fmas\u0131n\u0131 ve ayr\u0131ca antikor \u00fcretimini te\u015fvik eder. VEGFA, anjiyogeneze m\u00fcdahale edebilen g\u00fc\u00e7l\u00fc bir vask\u00fcler endotelyal b\u00fcy\u00fcme fakt\u00f6r\u00fcd\u00fcr ve \u00fclser iyile\u015fmesinde kilit bir rol oynayabilir. Hp enfeksiyonundan sonra, bu anahtar genler v\u00fccutla etkile\u015fime girer ve NF - \u03ba B sinyal kaskad\u0131 gibi yollar\u0131n arac\u0131l\u0131\u011f\u0131 alt\u0131nda, karma\u015f\u0131k bir imm\u00fcn inflamasyon d\u00fczenleyici a\u011f olu\u015ftururlar. Bu nedenle, Huangqin Huanglian ilac\u0131, birden fazla aktif bile\u015fenin do\u011frudan veya dolayl\u0131 etkisi yoluyla Hp ile ili\u015fkili PU \u00fczerinde terap\u00f6tik etkisini g\u00f6sterebilir.<\/p>\n
MikroRNA, yakla\u015f\u0131k 18-25 n\u00fckleotid uzunlu\u011funda tek sarmall\u0131 kodlamayan k\u00fc\u00e7\u00fck bir RNA t\u00fcr\u00fcd\u00fcr. Belirli hedef genlerin mRNA's\u0131n\u0131n 3' veya 5\u2032 UTR b\u00f6lgesine tamamlay\u0131c\u0131 baz e\u015fle\u015fmesi prensibiyle ba\u011flan\u0131r, \u00e7eviri inhibisyonunda veya mRNA'n\u0131n do\u011frudan bozulmas\u0131nda rol oynar. Bu \u00e7al\u0131\u015fma, Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n \u00e7ekirdek genleri \u00fczerinde mikroRNA arac\u0131l\u0131 gen ekspresyonu d\u00fczenlemesinin etkisini daha fazla ara\u015ft\u0131rmay\u0131 ama\u00e7lamaktad\u0131r. En i\u015flevsel mikroRNA'lar Target Scan ve starBase veritabanlar\u0131 arac\u0131l\u0131\u011f\u0131yla al\u0131nm\u0131\u015f ve taranm\u0131\u015ft\u0131r. Sonu\u00e7lar miR-93-5p, miR-374b-5p, miR-3937, miR-19a-3p, miR-4458, miR-590-5p, miR-6838-5p ve miR-424-5p'yi g\u00f6stermi\u015ftir. Bu mikroRNA'lar\u0131n ke\u015ffi, Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n kodlamayan RNA d\u00fczeyinde Hp ile ili\u015fkili PU tedavisindeki molek\u00fcler mekanizmas\u0131n\u0131 daha da ayd\u0131nlatm\u0131\u015ft\u0131r.<\/p>\n
\u00d6zetle, a\u011f farmakolojisi ve biyoinformati\u011fe dayanan bu \u00e7al\u0131\u015fma, Scutellaria baicalensis Georgi ve Coptis chinensis'in Hp ile ili\u015fkili PU tedavisindeki ana molek\u00fcler a\u011f d\u00fczenleme mekanizmas\u0131n\u0131 ara\u015ft\u0131rm\u0131\u015ft\u0131r, Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde Scutellaria baicalensis Georgi ve Coptis chinensis taraf\u0131ndan d\u00fczenlenen \u00e7ekirdek genleri ve anahtar mikroRNA'lar\u0131 netle\u015ftirmi\u015f ve Scutellaria baicalensis Georgi ve Coptis chinensis'in \u00e7ok bile\u015fenli, \u00e7ok hedefli ve \u00e7ok kanall\u0131 sinerjik etkisinin \u00f6zelliklerini do\u011frulam\u0131\u015ft\u0131r. Bu makalenin ara\u015ft\u0131rma sonu\u00e7lar\u0131, Hp ile ili\u015fkili PU'nin patogenezi ve farmakolojik etkileri \u00fczerine yap\u0131lan mevcut \u00e7al\u0131\u015fmalarla tutarl\u0131d\u0131r ve bu da bir dereceye kadar bu makalenin g\u00fcvenilirli\u011fini do\u011frulamaktad\u0131r. Bu makalenin ara\u015ft\u0131rma sonu\u00e7lar\u0131, Hp ile ili\u015fkili PU tedavisinde Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n klinik tan\u0131t\u0131m\u0131 ve uygulamas\u0131 i\u00e7in bilimsel temel sa\u011flayabilir ve gelecekteki derinlemesine deneysel ara\u015ft\u0131rmalar i\u00e7in fikir ve referanslar sa\u011flayabilir.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Helicobacter pylori ile ili\u015fkili peptik \u00fclserlerin tedavisi i\u00e7in Huangqin Huanglian ilac\u0131n\u0131n \u00e7ekirdek genleri ve anahtar mikroRNA taramas\u0131 \u00fczerine ara\u015ft\u0131rma Peptik \u00fclser (PU), mide ve duodenumda ortaya \u00e7\u0131kma e\u011filiminde olan klinik uygulamada en yayg\u0131n sindirim sistemi hastal\u0131klar\u0131ndan biridir. P\u00dc insidans oran\u0131 farkl\u0131 \u00fclkelerde de\u011fi\u015fkenlik g\u00f6stermektedir [...]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n