Pseudomonas aeruginosa quorum sensing sistemine dayal\u0131 potansiyel antibakteriyel \u00c7in bitkisel ila\u00e7 taramas\u0131 \u00fczerine ara\u015ft\u0131rma
\nPseudomonas aeruginosa (PA) \u00e7e\u015fitli enfeksiyonlarla ili\u015fkilidir. Son zamanlarda yap\u0131lan \u00e7al\u0131\u015fmalar, antibiyotik tedavisi s\u0131ras\u0131nda \u00e7ekirdek alg\u0131lama yoluyla PA'ya kar\u015f\u0131 direncin artt\u0131\u011f\u0131n\u0131 ortaya koymu\u015ftur. Son y\u0131llarda, antibiyotiklerin yayg\u0131n kullan\u0131m\u0131 nedeniyle, PA birden fazla antibiyoti\u011fe kar\u015f\u0131 diren\u00e7 geli\u015ftirmi\u015f ve klinik PA enfeksiyonlar\u0131n\u0131n tedavisini \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde zorla\u015ft\u0131rm\u0131\u015ft\u0131r. \u0130laca diren\u00e7li PA'y\u0131 bask\u0131lamak i\u00e7in yeni ila\u00e7lar aramak acil bir k\u00fcresel sorun haline gelmi\u015ftir. B\u00f6lgemizdeki geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131n\u0131n bol kaynaklar\u0131 g\u00f6z \u00f6n\u00fcne al\u0131nd\u0131\u011f\u0131nda, bu proje geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131ndan ba\u015flamay\u0131 ve quorum sensing'de yer alan anahtar proteinleri hedeflemeyi d\u00fc\u015f\u00fcnmektedir. Molek\u00fcler yerle\u015ftirme y\u00f6ntemi kullan\u0131larak, geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131 bile\u015fik k\u00fct\u00fcphanesindeki aktif b\u00f6lgeler i\u00e7in y\u00fcksek afiniteye sahip ligand molek\u00fclleri aranacakt\u0131r. Sanal taraman\u0131n sonu\u00e7lar\u0131n\u0131 do\u011frulamak i\u00e7in antibakteriyel testler kullanarak, antibiyotiklerle kombinasyon halinde klinik uygulamada PA direncini engelleyebilecek \u00c7in bitkisel ila\u00e7lar\u0131n\u0131 tan\u0131mlamay\u0131 ama\u00e7l\u0131yoruz.
\nQuorum sensing (QS), bakteri pop\u00fclasyonlar\u0131nda vir\u00fclans ifadesini koordine eden h\u00fccreler aras\u0131 bir ileti\u015fim sistemidir. Mekanizma be\u015f noktadan olu\u015fur: (1) Efluks pompas\u0131 genlerinin a\u015f\u0131r\u0131 ekspresyonu; (2) \u0130naktive edici enzimlerin ila\u00e7lar\u0131 hidrolize etmesi; (3) Biyofilm olu\u015fumu; (4) Hedef mutasyonu; (5) D\u0131\u015f membran ge\u00e7irgenli\u011finin azalmas\u0131.
\nPA'n\u0131n quorum alg\u0131lama sistemi en az d\u00f6rt alt sistem i\u00e7erir: Pseudomonas kinolon sinyali (PQS), entegre quorum sensing sinyali (IQS) ve LAS ve RHL sistemleri. Bu nedenle, geleneksel antibiyotiklerle kar\u015f\u0131la\u015ft\u0131r\u0131ld\u0131\u011f\u0131nda, quorum sensing inhibit\u00f6rleri (QSI'ler) PA'n\u0131n toksisitesini azaltabilir, ila\u00e7 direncini azaltabilir, sepsisi \u00f6nleyebilir ve antibiyotik tedavisinin hassasiyetini art\u0131rabilir.<\/p>\n
Klinik uygulamada antibiyotiklerin terap\u00f6tik etkinli\u011fi a\u00e7\u0131s\u0131ndan \u00f6nemli zorluklar te\u015fkil eden PA direnci sorunu giderek daha ciddi bir hal almaktad\u0131r. QS sistemi, \u00f6zellikle PA olmak \u00fczere \u00e7e\u015fitli bakterilerde yayg\u0131n olarak bulunur ve bakterilerin patojenitesini ve ila\u00e7 direncini d\u00fczenleyen sistemler aras\u0131nda kademeli d\u00fczenleme sergiler. Geleneksel antibiyotiklerle kar\u015f\u0131la\u015ft\u0131r\u0131ld\u0131\u011f\u0131nda, QSI'ler normal bakteriyel b\u00fcy\u00fcmeyi etkilemeden, bakteriyel vir\u00fclans\u0131 azaltmadan ve bakteriyel toksinlerin yay\u0131lmas\u0131n\u0131 engellemeden hedef bakterilerin QS sistemini uygun konsantrasyonlarda inhibe edebilir. Bu makalede kullan\u0131lan be\u015f protein farkl\u0131 yolak proteinlerine kar\u015f\u0131l\u0131k gelmektedir. Bunlar aras\u0131nda 5EOE, \u03b2 - laktam halkas\u0131n\u0131 par\u00e7alamak i\u00e7in inaktive edici enzimler \u00fcretebilen ve bu t\u00fcr antibiyotiklerin inaktivasyonuna yol a\u00e7an BEL-1 tipi bir proteindir; 4HEF, quorum sensing LAS alt sistemine ait bir sefalosporin hidrolaz kompleksidir. Serin \u03b2 - laktaz\u0131, \u03b2 - laktaza benzer bir kovalent ba\u011flay\u0131c\u0131 enzim kompleksi olu\u015fturarak inhibe eder ve geni\u015f spektrumlu inhibit\u00f6r performans\u0131 i\u00e7in yap\u0131sal bir temel sa\u011flar; 4ZZL, Pseudomonas aeruginosa'daki MexAB OprM \u00e7oklu ila\u00e7 ak\u0131\u015f pompas\u0131 operat\u00f6r\u00fcn\u00fcn bir inhibit\u00f6r\u00fc olan MexR-R21W'nin bir mutant\u0131d\u0131r. DNA ba\u011flanma hasar\u0131 mutasyonu \u00e7oklu ila\u00e7 direncine yol a\u00e7ar. 4NR0, PA i\u00e7in \u00fcretilen ve vir\u00fclans fakt\u00f6r\u00fc 3-okso-C12HSL sentezinde \u00f6nemli bir rol oynayan bir enoil ACP red\u00fcktazd\u0131r. 3H78, kinolon pseudomonas'\u0131n sinyal biyosentetik enzim mutant\u0131 ve bakteride biyosentez i\u00e7in \u00f6nemli bir kataliz\u00f6r olan orto aminobenzoattan olu\u015fan bir komplekstir. Bu kompleksin inhibe edilmesi, PQS sistemindeki vir\u00fclans fakt\u00f6rlerinin \u00fcretimini azaltabilir ve ila\u00e7 direncini d\u00fc\u015f\u00fcrebilir.
\nSon y\u0131llarda yap\u0131lan \u00e7al\u0131\u015fmalar, yayg\u0131n olarak kullan\u0131lan baz\u0131 klinik ila\u00e7lar\u0131n da QSIs aktivitesine sahip oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. Geleneksel bir ate\u015f d\u00fc\u015f\u00fcr\u00fcc\u00fc ve analjezik ila\u00e7 olan aspirinin 6 mg\/mL konsantrasyonda PA'n\u0131n b\u00fcy\u00fcmesini etkilemedi\u011fi, ayn\u0131 zamanda elastaz ve piyosiyanin gibi QS vir\u00fclans fakt\u00f6rleri \u00fczerinde belirli bir inhibit\u00f6r etki g\u00f6sterdi\u011fi bulunmu\u015ftur. \u0130nsektisit kloramfenikol, PA vir\u00fclans fakt\u00f6rlerinin \u00fcretimini ve biyofilm olu\u015fumunu engelleyebilir. Buna ek olarak, baz\u0131 yapay olarak sentezlenmi\u015f ila\u00e7lar da QSI'lerin \u00f6zelliklerine sahiptir. \u00d6rne\u011fin, furanon (5Z)-4-bromo-5- (bromometilen)-3-butil-2- (5H)- furanon), furanon C-30'a dayanan sentetik bir t\u00fcrev, efluks pompalar\u0131n\u0131n ve vir\u00fclans fakt\u00f6rlerinin ekspresyonunu inhibe ederek PA biyofilminin antibiyotiklere duyarl\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 art\u0131rabilir. Ancak \u015fimdiye kadar, bu \u00e7al\u0131\u015fmalar\u0131n neredeyse tamam\u0131 laboratuvar alan\u0131nda kalm\u0131\u015ft\u0131r ve klinik aktiviteleri hala daha fazla ara\u015ft\u0131rmaya ihtiya\u00e7 duymaktad\u0131r.
\nBu makale, 2733 yayg\u0131n \u00c7in bitkisel ilac\u0131n\u0131n aktif bile\u015fenlerini sanal olarak taramak i\u00e7in MOE yaz\u0131l\u0131m\u0131n\u0131 kullanmakta ve ilaca diren\u00e7li su\u015flar \u00fczerinde inhibit\u00f6r etkileri olabilecek 7 \u00c7in bitkisel ilac\u0131n\u0131 elde etmektedir: safran, rami k\u00f6k\u00fc, koyun toyna\u011f\u0131 t\u0131rna\u011f\u0131, ate\u015f k\u00f6m\u00fcr\u00fc anas\u0131, yaprak incisi, su \u00e7am\u0131 ve \u00e7ok \u00e7i\u00e7ekli yabani \u015fakay\u0131k. Daha sonra, ilgili antibakteriyel do\u011frulama yap\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r ve sonu\u00e7lar molek\u00fcler yerle\u015ftirme hesaplamalar\u0131yla tutarl\u0131d\u0131r, bu da bu taraman\u0131n belirli bir derecede rasyonelli\u011fe sahip oldu\u011funu g\u00f6stermektedir. Bu \u00e7al\u0131\u015fmada kullan\u0131lan bilgisayar sanal tarama y\u00f6ntemi d\u00fc\u015f\u00fck maliyet ve y\u00fcksek verimlilik \u00f6zelliklerine sahiptir. Geleneksel farmakolojik deneylerde hesaplamalar\u0131n birle\u015ftirilmesi daha verimli ara\u015ft\u0131rmalara yol a\u00e7abilir. Bununla birlikte, baz\u0131 geleneksel \u00c7in ila\u00e7lar\u0131n\u0131n sanal hesaplamada elde edilmedi\u011fini, ancak ger\u00e7ek taramada antibakteriyel aktivite g\u00f6sterdi\u011fini (Yanfumu, Xiqingguo, Hezi, vb.) belirtmek gerekir; bu, bu y\u00f6ntemin hala nispeten ham oldu\u011funu, sapmalar ve eksiklikler oldu\u011funu ve iyile\u015ftirilmesi gerekti\u011fini g\u00f6sterir. Daha sonraki a\u015famada, sistemin hareketlili\u011fi ve inhibisyon mekanizmas\u0131 gibi \u00f6nemli bilimsel konular\u0131 analiz etmek i\u00e7in molek\u00fcler dinamik sim\u00fclasyonu kullan\u0131lacakt\u0131r.
\nBu makalede se\u00e7ilen \u00c7in bitkileri ile ilgili olarak Chen ve arkada\u015flar\u0131, belirli ko\u015fullar alt\u0131nda safran\u0131n PA biyofilmi \u00fczerinde belirli bir temizleme etkisine sahip oldu\u011funu, hatta tamamen temizledi\u011fini g\u00f6zlemlemi\u015ftir; Song ve arkada\u015flar\u0131, \u00c7in \u015fifal\u0131 bitkisi Charcoal ekstrakt\u0131n\u0131n PA b\u00fcy\u00fcmesi \u00fczerinde belirli bir inhibit\u00f6r etkiye sahip oldu\u011funu ve minimum inhibit\u00f6r konsantrasyonunun 15.63 mg \/ mL oldu\u011funu bulmu\u015ftur; Pandey ve arkada\u015flar\u0131, in vitro antibakteriyel deneyler yoluyla koyun toynak b\u00f6ce\u011fi ekstraktlar\u0131n\u0131n (yapraklar, g\u00f6vde kabu\u011fu ve \u00e7i\u00e7ekler) PA \u00fczerinde belirli bir antibakteriyel etkiye sahip oldu\u011funu bulmu\u015ftur.
\nBu makalenin bir di\u011fer amac\u0131 da antibiyoti\u011fe diren\u00e7li PA enfeksiyonlar\u0131na klinik yan\u0131tlar sa\u011flamakt\u0131r. Halihaz\u0131rda, terap\u00f6tik etkilerini g\u00f6zlemlemek ve baz\u0131 ilerlemeler kaydetmek i\u00e7in amoksisilin, sefotaksim ve levofloksasin ile kaynat\u0131lacak ve birle\u015ftirilecek \u00e7e\u015fitli geleneksel \u00c7in ila\u00e7lar\u0131n\u0131 se\u00e7mek i\u00e7in klinik departmanlarla i\u015fbirli\u011fi yap\u0131yoruz. Bununla birlikte, klinik \u00c7in t\u0131bb\u0131 uygulay\u0131c\u0131lar\u0131 daha iyi prognoz elde etmek i\u00e7in daha g\u00fc\u00e7l\u00fc geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131 form\u00fcllerine ihtiya\u00e7 duyuldu\u011fu y\u00f6n\u00fcnde geri bildirimde bulunmu\u015flard\u0131r. Bile\u015fiklerin \u00e7o\u011fu hala biyolojik aktivite ara\u015ft\u0131rmas\u0131 veya preklinik ara\u015ft\u0131rma a\u015famas\u0131nda olmas\u0131na ve klinik deneme a\u015famas\u0131na giren nispeten az say\u0131da bile\u015fik olmas\u0131na ra\u011fmen, gelecekte hala \u00e7ok fazla belirsizlik olacakt\u0131r. Bununla birlikte, farkl\u0131 etki mekanizmalar\u0131na sahip bu bile\u015fikler ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar i\u00e7in de\u011ferli deneyim ve ara\u015ft\u0131rma fikirleri sa\u011flayarak yeni antibakteriyel ila\u00e7lar\u0131n ortaya \u00e7\u0131kmas\u0131n\u0131 m\u00fcmk\u00fcn k\u0131lmaktad\u0131r. QSI'lerin iyi uygulama beklentileri vard\u0131r ve bildirilen QSI'ler hala s\u0131n\u0131rl\u0131d\u0131r. T\u0131pta bakteriyel diren\u00e7 sorununu \u00e7\u00f6zmek i\u00e7in insan kullan\u0131m\u0131na ger\u00e7ekten uygun olan g\u00fcvenli ve verimli QSI'lerin \u00e7al\u0131\u015f\u0131lmas\u0131 gerekmektedir.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Research on potential antibacterial Chinese herbal medicine screening based on Pseudomonas aeruginosa quorum sensing system Pseudomonas aeruginosa (PA) is associated with various infections. Recent studies have found that resistance to PA is enhanced through quorum sensing during antibiotic treatment. In recent years, due to the widespread use of antibiotics, PA has developed resistance to multiple […]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n