Huanglian tohumlar\u0131ndaki endofitik bakterilerin izolasyonu, tan\u0131mlanmas\u0131 ve fonksiyonel do\u011frulamas\u0131
\nTohumlar bitkilerin \u00f6nemli \u00fcreme organlar\u0131d\u0131r ve germplazm kaynaklar\u0131n\u0131n korunmas\u0131nda ve tar\u0131msal \u00fcretimde b\u00fcy\u00fck \u00f6neme sahiptir. Endofitik bakteriler tohumlarla yak\u0131ndan ili\u015fkilidir ve tohumun farkl\u0131 k\u0131s\u0131mlar\u0131nda (tohum kabu\u011fu, embriyo, endosperm) ve tohumun t\u00fcm b\u00fcy\u00fcme ve geli\u015fme a\u015famas\u0131 boyunca bulunur. Farkl\u0131 kaynaklardan elde edilen tohumlardaki mikrobiyal taksonlar b\u00fcy\u00fck \u00f6l\u00e7\u00fcde \u00f6rt\u00fc\u015fmektedir; tohumlarda bulunan endofitik bakteriler 4 filum ve 131 cinse aittir. Bunlar aras\u0131nda Proteobacteria ve Gamma Proteobacteria farkl\u0131 tohumlardaki bask\u0131n gruplar iken Bacillus, Pseudomonas, Bacillus benzeri, Micrococcus, Staphylococcus ve Pseudomonas farkl\u0131 bitki tohumlar\u0131nda en yayg\u0131n olanlard\u0131r. Danshen, pirin\u00e7, yonca ve di\u011fer tohum endofitik bakterileri t\u00fcr bak\u0131m\u0131ndan zengindir, \u00e7ok say\u0131da fonksiyonel gen ta\u015f\u0131r ve do\u011frudan veya dolayl\u0131 etkiler yoluyla tohum geli\u015fimini te\u015fvik eder. Tohumlardaki endofitik bakteriler, tohum geli\u015fimi ve \u00e7imlenmeyle ilgili \u00e7e\u015fitli fizyolojik i\u015flevlere sahiptir. Azotu sabitleyerek, fosforu \u00e7\u00f6zerek, bitki hormonlar\u0131, ACC deaminaz \u00fcreterek, demir ta\u015f\u0131y\u0131c\u0131lar\u0131 \u00fcreterek ve besin emilimini te\u015fvik ederek tohum geli\u015fimini ve bitki b\u00fcy\u00fcmesini desteklerler. Ayr\u0131ca antibiyotikler, hidrolitik enzimler (pektinaz, amilaz, sel\u00fclaz vb.) \u00fcretir, savunma mekanizmalar\u0131n\u0131 tetikler ve tohumlar\u0131n i\u00e7indeki maddelerin d\u00f6n\u00fc\u015f\u00fcm\u00fcn\u00fc te\u015fvik ederek biyotik veya abiyotik stresin bitkilere verdi\u011fi zarar\u0131 azalt\u0131rlar.
\nCoptis chinensis Franch. kuru rizomlar\u0131 ila\u00e7 olarak kullan\u0131lan Ranunculaceae'deki Coptis cinsinin \u00e7ok y\u0131ll\u0131k bir bitkisidir. Bir\u00e7ok geleneksel \u00c7in patentli ilac\u0131n ve basit preparatlar\u0131n hammaddelerinden biridir ve geni\u015f bir yapay ekim alan\u0131na sahiptir. Bununla birlikte, Huanglian tohumlar\u0131 olgunla\u015fma sonras\u0131 morfolojik ve fizyolojik \u00f6zelliklere sahiptir ve d\u00fc\u015f\u00fck \u00e7imlenme oran\u0131 ile olgunla\u015fmak ve \u00e7imlenmek i\u00e7in bitkiden d\u00fc\u015ft\u00fckten sonra 9 ayl\u0131k de\u011fi\u015fken s\u0131cakl\u0131k katman\u0131na ihtiya\u00e7 duyar; Depolama s\u0131ras\u0131nda dehidrasyona dayanamamak, tohumun korunmas\u0131 ve kalite kontrol\u00fcn\u00fcn yan\u0131 s\u0131ra Huanglian'\u0131n tan\u0131t\u0131m\u0131 ve yeti\u015ftirilmesi i\u00e7in zorluklar yarat\u0131r ve bu da t\u0131bbi malzemelerin verimini ve kalitesini etkiler. Ara\u015ft\u0131rma grubunun \u00f6n metagenomik ara\u015ft\u0131rmas\u0131, Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n oksidatif fosforilasyon, trikarboksilik asit d\u00f6ng\u00fcs\u00fc, pentoz fosfat, glikoliz glukoneogenez gibi yollara kat\u0131labilen bol miktarda endofitik bakteriye sahip oldu\u011funu buldu. Bu yollar tohum geli\u015fimi ve bitki b\u00fcy\u00fcmesi ile yak\u0131ndan ilgilidir ve mikroorganizmalar\u0131n Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n olgunla\u015fma sonras\u0131 ve \u00e7imlenme s\u00fcrecinde rol oynayabilece\u011fi tahmin edilmektedir.
\nHuanglian tohumlar\u0131ndaki endofitik bakterilerin geli\u015fimini daha fazla ara\u015ft\u0131rmak amac\u0131yla, bu \u00e7al\u0131\u015fmada Huanglian tohumlar\u0131ndan plaka izolasyonu yoluyla yeti\u015ftirilebilir endofitik bakteriler elde edilmi\u015ftir. Huanglian tohumlar\u0131ndaki endofitik bakteriler 16S rRNA ile tan\u0131mlanm\u0131\u015f ve fosfor \u00e7\u00f6z\u00fcn\u00fcrle\u015ftirme, azot fiksasyonu ve IAA \u00fcretimi gibi b\u00fcy\u00fcmeyi te\u015fvik edici \u00f6zellikleri belirlenmi\u015ftir. Endofitik bakterilerin te\u015fvik i\u015flevi tohum \u00e7imlendirme deneyleri ile do\u011frulanm\u0131\u015ft\u0131r. Tohum olgunla\u015fmas\u0131 ve \u00e7imlenmesi i\u00e7in faydal\u0131 olan endofitik bakterilerin taranmas\u0131 amac\u0131yla, bitki endofitik bakterilerinin te\u015fvik mekanizmas\u0131n\u0131n ve inat\u00e7\u0131 tohum olgunla\u015fmas\u0131 ve \u00e7imlenmesi mekanizmas\u0131n\u0131n ortaya \u00e7\u0131kar\u0131lmas\u0131 i\u00e7in teorik bir temel sa\u011flanmas\u0131 ama\u00e7lanm\u0131\u015ft\u0131r. Ayn\u0131 zamanda, yeni ve verimli mikrobiyal g\u00fcbrelerin ara\u015ft\u0131r\u0131lmas\u0131 ve geli\u015ftirilmesi i\u00e7in de temel olu\u015fturmaktad\u0131r.<\/p>\n
<\/p>\n
<\/p>\n
Truyens ve arkada\u015flar\u0131 Bacillus ve Pseudomonas'\u0131n farkl\u0131 bitkilerin tohumlar\u0131nda bask\u0131n gruplar oldu\u011funu, Bacillus, Micrococcus, Staphylococcus, Pseudomonas ve Acinetobacter'in de tohumlardaki endofitik bakterilerde \u00e7ok yayg\u0131n oldu\u011funu bulmu\u015ftur. Bu \u00e7al\u0131\u015fmada nesne olarak Huanglian tohumlar\u0131 kullan\u0131lm\u0131\u015f ve aralar\u0131nda bask\u0131n bakterilerin Bacillus ve Pseudomonas oligotrofik oldu\u011fu 13 cinse da\u011f\u0131lm\u0131\u015f 29 endofitik bakteri izole ve te\u015fhis edilmi\u015ftir. Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n b\u00fcy\u00fcmeyi te\u015fvik edici \u00f6zellikleri \u00fczerine yap\u0131lan ara\u015ft\u0131rmalar, endofitik bakterilerin IAA \u00fcretme, fosforu \u00e7\u00f6zme, azotu sabitleme ve demir ta\u015f\u0131y\u0131c\u0131lar\u0131 \u00fcretme i\u015flevlerine sahip oldu\u011funu g\u00f6stermektedir. Ba Toyonensis ZZ-4 IAA ve demir ta\u015f\u0131y\u0131c\u0131lar\u0131 \u00fcretebilirken, Pr. megaterium ZZ-24 IAA \u00fcretebilir ve fosfor \u00e7\u00f6z\u00fcn\u00fcrle\u015ftirme i\u015flevine sahiptir gibi baz\u0131 endofitik bakteriler de birden fazla b\u00fcy\u00fcmeyi te\u015fvik edici i\u015fleve sahiptir. Tohum \u00e7imlendirme deneyi ayr\u0131ca Huanglian tohumlar\u0131ndaki b\u00fcy\u00fcmeyi destekleyici i\u015flevlere sahip endofitik bakterilerin \u00e7o\u011funlukla Bacillus cinsinde da\u011f\u0131ld\u0131\u011f\u0131n\u0131 do\u011frulam\u0131\u015ft\u0131r. Gagne Bourgue ve arkada\u015flar\u0131n\u0131n ara\u015ft\u0131rma sonu\u00e7lar\u0131 Bacillus subtilis'in IAA, sitokinin \u00fcretme ve fosfor \u00e7\u00f6z\u00fcn\u00fcrle\u015ftirme \u00f6zelliklerine sahip oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. Lu ve arkada\u015flar\u0131, Boju'daki Bacillus subtilis BN7'nin fosfor, potasyum ve IAA'y\u0131 hidrolize edebildi\u011fini belirlemi\u015ftir. Bu nedenle, Bacillus cinsi Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n olgunla\u015fma sonras\u0131 ve \u00e7imlenme s\u00fcrecinde \u00f6nemli bir rol oynayabilir ve tar\u0131msal \u00fcretimde b\u00fcy\u00fck bir geli\u015fme ve kullan\u0131m de\u011ferine sahiptir.
\nFosfor toprakta \u00e7\u00f6z\u00fcnmeyen inorganik fosfor ve organik fosfor \u015feklinde bulunur. Fosforun sadece k\u00fc\u00e7\u00fck bir k\u0131sm\u0131 toprakta \u00e7\u00f6z\u00fcnebilir ve bitkiler taraf\u0131ndan emilip kullan\u0131labilir. Bitkilerdeki fosforu \u00e7\u00f6zme yetene\u011fine sahip endofitik bakteriler, bitkiler i\u00e7in emilmesi zor olan fosforu kolayca emilebilir formlara d\u00f6n\u00fc\u015ft\u00fcrebilir ve b\u00f6ylece bitki b\u00fcy\u00fcmesini ve geli\u015fimini te\u015fvik edebilir. Xie ve arkada\u015flar\u0131 taraf\u0131ndan bitkilerin rizosfer topra\u011f\u0131ndan izole edilen Pseudomonas brassicacearum H9, y\u00fcksek fosfat \u00e7\u00f6z\u00fcnd\u00fcrme aktivitesine sahip bir bakteridir. Bakteriyel s\u00fcspansiyonu bu\u011fday ve salatal\u0131k tohumlar\u0131n\u0131n \u00e7imlenmesini \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde destekler. Buna ek olarak, tohum \u00e7imlenmesi ve fide b\u00fcy\u00fcmesi IAA taraf\u0131ndan d\u00fczenlenir ve orta derecede d\u0131\u015fsal IAA tohum \u00e7imlenmesini ve bitki k\u00f6k geli\u015fimini te\u015fvik edebilir; Xu ve ark. domates, pirin\u00e7, kolza tohumu ve turp gibi bitkilerin k\u00f6klerinde, g\u00f6vdelerinde ve yapraklar\u0131nda kolonize olan ve fideler \u00fczerinde \u00e7e\u015fitli derecelerde b\u00fcy\u00fcmeyi te\u015fvik edici etkileri olan domates ve pirin\u00e7 tohumlar\u0131ndan IAA \u00fcretebilen \u00fc\u00e7 endofitik bakteri izole etmi\u015ftir. Khalaf ve arkada\u015flar\u0131 kavun tohumlar\u0131ndan oksin salg\u0131layabilen 56 endofitik bakteri elde etmi\u015f olup, Bacillus ve Escherichia bask\u0131n cinslerdir. Sesbania tohumlar\u0131nda oksin \u00fcretebilen endofitik bakterilerin IAA salg\u0131lama aral\u0131\u011f\u0131 1.29-25.47mg\/L'dir. Ba. velezensis SC60 en y\u00fcksek IAA \u00fcretimine sahiptir ve embriyonik k\u00f6k geli\u015fimini \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde destekler ve tohum canl\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 art\u0131r\u0131r. Bu deneyde IAA salg\u0131layabilen alt\u0131 endofitik bakteri elde edilmi\u015ftir ve bunlar\u0131n aras\u0131nda ZZ-6, ZZ-21, ZZ-24 ve ZZ-29 100mg\/L'den fazla Pr salg\u0131lam\u0131\u015ft\u0131r. Bu bakteriler hem fosforu \u00e7\u00f6zebilir hem de y\u00fcksek IAA \u00fcretebilir Megaterium ZZ-24, Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n b\u00fcy\u00fcmesi \u00fczerinde \u00f6nemli bir te\u015fvik edici etkiye sahiptir. Tohumlardaki endofitik bakterilerin b\u00fcy\u00fcmeyi te\u015fvik eden \u00e7e\u015fitli \u00f6zelliklerinin daha fazla ara\u015ft\u0131r\u0131lmas\u0131 ve \u00e7ok i\u015flevli endofitik bakterilerin ortaya \u00e7\u0131kar\u0131lmas\u0131, tohum geli\u015fimi ve \u00e7imlenmesindeki endofitik bakteri mekanizmas\u0131n\u0131n ayd\u0131nlat\u0131lmas\u0131na yard\u0131mc\u0131 olacakt\u0131r.
\nHuanglian tohumlar\u0131nda b\u00fcy\u00fcmeyi te\u015fvik eden \u00e7e\u015fitli endofitik bakteriler vard\u0131r ve bask\u0131n bakteriler \u00e7o\u011funlukla fosforu \u00e7\u00f6zebilen ve Pr Megaterium ZZ-24'te y\u00fcksek IAA \u00fcretebilen Bacillus cinsinde da\u011f\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r, Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n b\u00fcy\u00fcmesini te\u015fvik etmek i\u00e7in iyi bir yetene\u011fe sahiptir, bu da ara\u015ft\u0131rma ve geli\u015ftirme potansiyelini g\u00f6sterir. \u00c7oklu b\u00fcy\u00fcme te\u015fvik edici yeteneklere sahip endofitik bakteriler, Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n uzun vadeli olgunla\u015fma sonras\u0131 s\u00fcrecinde rol oynayabilir ve bu da Huanglian tohumlar\u0131n\u0131n olgunla\u015fma sonras\u0131 tamamlanmas\u0131 ve ba\u015far\u0131l\u0131 bir \u015fekilde \u00e7imlenmesi i\u00e7in \u00f6nemli bir fakt\u00f6r olabilir.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Isolation, identification, and functional verification of endophytic bacteria in Huanglian seeds Seeds are important reproductive organs of plants and have significant importance in the preservation of germplasm resources and agricultural production. Endophytic bacteria are closely related to seeds and exist in different parts of the seed (seed coat, embryo, endosperm) as well as throughout the […]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n