Zebra bal\u0131\u011f\u0131 modeli ve dinamik molek\u00fcler yerle\u015ftirme teknolojisine dayal\u0131 olarak Amerikan ginsenginin anti hipoksi etkisinin ve potansiyel hedeflerinin ara\u015ft\u0131r\u0131lmas\u0131
\nHipoksi, birden fazla fakt\u00f6r\u00fcn neden oldu\u011fu karma\u015f\u0131k bir patolojik s\u00fcre\u00e7tir ve v\u00fccutta de\u011fi\u015fen derecelerde solunum g\u00fc\u00e7l\u00fc\u011f\u00fc anlam\u0131na gelir. Solunum yolu ile yeterli oksijen al\u0131namamas\u0131 v\u00fccutta ciltte, parmaklarda, dudaklarda siyanoz gibi patolojik de\u011fi\u015fikliklere ve hatta h\u0131r\u0131lt\u0131l\u0131 solunum, nefes darl\u0131\u011f\u0131 ve g\u00f6\u011f\u00fcste s\u0131k\u0131\u015fma hissi gibi semptomlara yol a\u00e7ar. Hipoksi kalp, beyin ve akci\u011ferler gibi birden fazla organda geri d\u00f6n\u00fc\u015f\u00fc olmayan hasara neden olabilir ve bu da akci\u011fer \u00f6demi veya beyin \u00f6demi gibi \u00f6l\u00fcmc\u00fcl hastal\u0131klara d\u00f6n\u00fc\u015febilir. Geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131, iyi anti hipoksi etkileri oldu\u011fu kan\u0131tlanm\u0131\u015f olan kar lotusu ve palmiye ginsengi gibi anti hipoksi ara\u015ft\u0131rmalar\u0131nda ve klinik uygulamalarda bariz avantajlara sahiptir. \u00dclkemizin e\u015fsiz t\u0131bbi bitki kaynaklar\u0131n\u0131 daha derinlemesine ara\u015ft\u0131rmak ve daha etkili ve d\u00fc\u015f\u00fck toksisiteli ila\u00e7lar ke\u015ffetmek, y\u00fcksek rak\u0131ml\u0131 ortamlar\u0131n veya patolojinin neden oldu\u011fu hipoksinin \u00f6nlenmesi ve tedavisi i\u00e7in hala b\u00fcy\u00fck \u00f6nem ta\u015f\u0131maktad\u0131r.<\/p>\n
G\u00fcn\u00fcm\u00fczde, anti hipoksik hastal\u0131klar\u0131n ara\u015ft\u0131r\u0131lmas\u0131nda kullan\u0131lan ba\u015fl\u0131ca modeller s\u0131\u00e7an ve fare modelleridir. Ana y\u00f6ntemler aras\u0131nda a\u011f\u0131rl\u0131k ta\u015f\u0131yan y\u00fczme deneyleri, normobarik hipoksi tolerans deneyleri, sodyum nitrit zehirlenmesi hayatta kalma deneyleri ve b\u00fcy\u00fck \u00f6l\u00e7ekli ila\u00e7 taramas\u0131nda s\u0131n\u0131rlamalar\u0131 ve y\u00fcksek maliyetleri olan akut serebral iskemik hipoksi deneyleri yer almaktad\u0131r. Ara\u015ft\u0131rmalar, zebra bal\u0131\u011f\u0131n\u0131n sodyum s\u00fclfit yoluyla hipoksi modelleri olu\u015fturabilece\u011fini ve zebra bal\u0131\u011f\u0131n\u0131n y\u00fcksek yumurta \u00fcretimine, k\u0131sa deney d\u00f6ng\u00fclerine ve d\u00fc\u015f\u00fck maliyetlere sahip oldu\u011funu ve bu sayede y\u00fcksek verimli taramaya ula\u015fabilece\u011fini ortaya koymu\u015ftur. Bu nedenle, Amerikan ginsenginin anti hipoksi etkisini ara\u015ft\u0131rmak i\u00e7in model hayvan zebra bal\u0131\u011f\u0131n\u0131 kulland\u0131k ve Amerikan ginsenginin anti hipoksi etkisinin potansiyel hedeflerini aramak ve anti hipoksi mekanizmas\u0131n\u0131n incelenmesi i\u00e7in referans sa\u011flamak amac\u0131yla Amerikan ginsenginin aktif bile\u015fenlerini ve potansiyel hedeflerini taramak ve tahmin etmek i\u00e7in biyoinformatik teknikler ve y\u00f6ntemler kulland\u0131k.<\/p>\n
<\/p>\n
Bu makale, geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131 anti hipoksi \u00e7al\u0131\u015fmas\u0131 i\u00e7in yeni bir y\u00f6ntem sa\u011flayan yeni bir zebra bal\u0131\u011f\u0131 yavru anti hipoksi modeli olu\u015fturmaktad\u0131r. Bu deneyde d\u00fc\u015f\u00fck oksijenli bir ortam olu\u015fturmak i\u00e7in sodyum s\u00fclfit kullan\u0131lm\u0131\u015f, bir hipoksi modeli olu\u015fturmak i\u00e7in yayg\u0131n nitrojen doldurma y\u00f6nteminin yerini alm\u0131\u015f ve Amerikan ginsenginin anti hipoksi etkisi daha basit ve daha do\u011frudan bir i\u015flemle incelenmi\u015ftir. Zebra bal\u0131\u011f\u0131n\u0131n model hayvan olarak kullan\u0131lmas\u0131 deney s\u00fcresini k\u0131saltabilir, y\u00fcksek verimli tarama sa\u011flayabilir ve hipoksiyi bir b\u00fct\u00fcn olarak karakterize edebilir. Oksijenden mahrum b\u0131rak\u0131ld\u0131ktan sonra zebra bal\u0131\u011f\u0131 y\u00fczen kafa fenomeni ya\u015fayacak ve y\u00fczme duru\u015flar\u0131 dengesiz olacakt\u0131r. V\u00fccutlar\u0131 yataya paralel olmayacak ve her y\u00f6ne d\u00fczensiz bir \u015fekilde y\u00fczerek belirli bir s\u00fcre i\u00e7inde y\u00fczme h\u0131zlar\u0131n\u0131 art\u0131racaklard\u0131r. Bu \u00e7al\u0131\u015fmada, hipoksik ko\u015fullar alt\u0131nda farkl\u0131 gruplardaki zebra bal\u0131klar\u0131n\u0131n hayatta kalma s\u00fcreleri ve hipoksi sonras\u0131 n\u00f6rolojik davran\u0131\u015flar\u0131 (y\u00fczen kafa, y\u00fczme h\u0131z\u0131 ve mesafesi) de\u011ferlendirilmi\u015ftir. Amerikan ginsengi ekstrakt\u0131n\u0131n hipoksik ko\u015fullar alt\u0131nda zebra bal\u0131\u011f\u0131n\u0131n hayatta kalma s\u00fcresini \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde art\u0131rabilece\u011fi bulunmu\u015ftur. \u0130la\u00e7 konsantrasyonunun artmas\u0131yla, her bir zebra bal\u0131\u011f\u0131 grubunun y\u00fczen kafa oran\u0131 da \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde azalm\u0131\u015ft\u0131r. Hipoksi sonras\u0131 hareket mesafesi ve h\u0131z\u0131 da model gruptan \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde farkl\u0131yd\u0131. Y\u00fcksek doz ila\u00e7 grubunun n\u00f6rolojik davran\u0131\u015f\u0131 bo\u015f normoksik grubunkine yak\u0131nd\u0131, bu da Amerikan ginseng \u00f6z\u00fct\u00fcn\u00fcn \u00f6nemli bir anti hipoksi etkisine sahip oldu\u011funu g\u00f6stererek bir sonraki ad\u0131mda potansiyel anti hipoksi hedefleri bulmak i\u00e7in temel olu\u015fturdu.<\/p>\n
Amerikan ginsengi, Kanada'ya \u00f6zg\u00fc ve \u00c7in'in Jilin ve Shandong eyaletlerinde yayg\u0131n olarak yeti\u015ftirilen Araliaceae familyas\u0131ndaki Panax cinsinden bir bitkidir. Qing Hanedanl\u0131\u011f\u0131 d\u00f6neminin ba\u015flar\u0131nda Konf\u00fc\u00e7y\u00fcs\u00e7\u00fc hekim Wang Ang taraf\u0131ndan derlenen \"Bu Tu Ben Cao Bei Yao\" adl\u0131 kitapta Amerikan ginsenginin serin bir do\u011fas\u0131, tatl\u0131 tad\u0131, hafif ac\u0131l\u0131\u011f\u0131 ve qi'yi tonifiye etme, yin'i besleme, \u0131s\u0131y\u0131 temizleme ve s\u0131v\u0131 \u00fcretme gibi geleneksel etkileri oldu\u011fu kaydedilmi\u015ftir. Modern farmakoloji, Amerikan ginsenginin anti-t\u00fcm\u00f6r, kardiyovask\u00fcler koruma, ba\u011f\u0131\u015f\u0131kl\u0131k d\u00fczenlemesinin yan\u0131 s\u0131ra anti miyokardiyal iskemi, anti miyokardiyal oksidasyon ve di\u011fer etkiler dahil olmak \u00fczere \u00e7e\u015fitli farmakolojik aktivitelere sahip oldu\u011funu g\u00f6stermektedir. Bununla birlikte, \u015fimdiye kadar, insanlar\u0131n Amerikan ginsenginin anti hipoksi etkisi ve spesifik madde bile\u015fimi hedefleri hakk\u0131ndaki anlay\u0131\u015f\u0131 hala \u00e7ok s\u0131n\u0131rl\u0131d\u0131r. \u00d6nceki \u00e7al\u0131\u015fmalar, ginsenosid Rg3'\u00fcn hipoksik ko\u015fullar alt\u0131nda Eca-109 ve 786-0 h\u00fccrelerinin \u00e7o\u011falmas\u0131n\u0131 engelleyebildi\u011fini ve vask\u00fcler endotelyal b\u00fcy\u00fcme fakt\u00f6r\u00fc (VEGF) mRNA ekspresyonunda \u00f6nemli bir d\u00fc\u015f\u00fc\u015fe neden oldu\u011funu g\u00f6stermi\u015ftir. Ayr\u0131ca hipoksik ko\u015fullar alt\u0131nda hipoksi taraf\u0131ndan ind\u00fcklenen hipoksi ind\u00fcklenebilir fakt\u00f6r-1 \u03b1 (HIF-1 \u03b1), siklooksijenaz-2 (COX-2) ve n\u00fckleer fakt\u00f6r kappa B (NF - \u03ba B) ekspresyonunu inhibe edebilir; Ginsenoside Rb3 h\u00fccre zar\u0131n\u0131 stabilize edebilir, NOS ekspresyonunu ve aktivitesini inhibe edebilir ve hipoksik-iskemik n\u00f6ronal hasar \u00fczerinde \u00f6nemli bir koruyucu etkiye sahiptir. Bu nedenle, Amerikan ginsengindeki \u00f6nemli anti hipoksi aktif maddelerin derinlemesine ara\u015ft\u0131r\u0131lmas\u0131, kalite de\u011ferlendirmesi ve yeni ila\u00e7 geli\u015ftirme i\u00e7in b\u00fcy\u00fck \u00f6nem ta\u015f\u0131maktad\u0131r.<\/p>\n
PPI a\u011f\u0131n\u0131n topolojik analizi, AKT1, STAT3, HSP90AA1, JUN ve TNF'nin anti hipoksi i\u00e7in Amerikan ginsenginin \u00e7ekirdek hedef genleri olabilece\u011fini g\u00f6stermektedir. Bir serin\/treonin protein kinaz olarak AKT1, b\u00fcy\u00fcme fakt\u00f6rlerine ba\u011flanan PI3K taraf\u0131ndan aktive edilebilir ve apoptozla ilgili proteinler Bad, Caspase9, mTOR aktivitesi gibi a\u015fa\u011f\u0131 ak\u0131\u015f substratlar\u0131n\u0131 aktive etmek veya inhibe etmek i\u00e7in fosforile edilebilir, b\u00f6ylece h\u00fccre proliferasyonu, farkl\u0131la\u015fma, apoptoz ve g\u00f6\u00e7 gibi biyolojik s\u00fcre\u00e7lerin d\u00fczenlenmesine kat\u0131l\u0131r. Ara\u015ft\u0131rmalar, rekombinant lentivir\u00fcs arac\u0131l\u0131 Akt1 gen transfeksiyonunun, apoptozu inhibe ederek s\u0131\u00e7an BMSC'lerinin hipoksi tolerans\u0131n\u0131 \u00f6nemli \u00f6l\u00e7\u00fcde art\u0131rabilece\u011fini bulmu\u015ftur. STAT3, STAT ailesinin bir \u00fcyesidir ve h\u00fccre proliferasyonu, farkl\u0131la\u015fmas\u0131, apoptoz ve di\u011fer s\u00fcre\u00e7lerin d\u00fczenlenmesinde \u00f6nemli bir rol oynar. STAT3, hipoksi ile ind\u00fcklenen pulmoner arter d\u00fcz kas h\u00fccrelerinde \u00f6nemli bir rol oynar ve STAT3 sinyal yolunun bloke edilmesi, vask\u00fcler d\u00fcz kas h\u00fccrelerinin \u00e7o\u011falmas\u0131n\u0131 etkili bir \u015fekilde inhibe edebilir. HSP90AA1, \u0131s\u0131 \u015foku protein ailesinin bir \u00fcyesidir ve stres i\u00e7ermeyen h\u00fccrelerde en bol bulunan sitoplazmik proteinlerden biridir. H\u00fccresel homeostaz\u0131n korunmas\u0131nda kritik bir rol oynar ve hipoksik stres ko\u015fullar\u0131 alt\u0131nda d\u0131\u015f strese kar\u015f\u0131 h\u00fccre direncini art\u0131rabilir. JUN onkogen ailesine aittir ve MAPKs s\u00fcper ailesinin bir \u00fcyesidir. H\u00fccre proliferasyonu, inflamasyon, migrasyon ve invazyon gibi s\u00fcre\u00e7lere kat\u0131labilir. Hipoksik ko\u015fullar alt\u0131nda, fosforile c-jun N-terminal kinaz\u0131n ekspresyon seviyesindeki bir art\u0131\u015f, s\u0131\u00e7an pulmoner arter d\u00fcz kas h\u00fccrelerinin proliferasyonunu te\u015fvik edebilir. TNF, esas olarak monositler ve makrofajlar taraf\u0131ndan salg\u0131lanan, enflamatuar etkilerin d\u00fczenlenmesinde ve mikrobiyal patojenlere kar\u015f\u0131 konak savunmas\u0131nda \u00f6nemli bir rol oynayan pro-enflamatuar bir sitokindir. Hipoksi stresi s\u0131ras\u0131nda TNF, NF - \u03ba B yolu arac\u0131l\u0131\u011f\u0131yla HIF-1 \u03b1'n\u0131n (hipoksi ind\u00fcklenebilir fakt\u00f6r-1 \u03b1) transkripsiyon seviyesini d\u00fczenler.<\/p>\n
Bu \u00e7al\u0131\u015fma, dinamik molek\u00fcler yerle\u015ftirme yoluyla Amerikan ginsenginin anahtar bile\u015fiklerinin (ginsenosid F11, papaverin, ginsenosid RO, ginsenosid Rb3, ginsenosid Rg1, ginsenosid Rg3 gibi) hipoksi \u00e7ekirdek hedef genleri (AKT1, HSP90AA1, JUN, STAT3, TNF) ile iyi bir \u015fekilde ba\u011flanabilece\u011fini buldu. Bu molek\u00fcler yerle\u015ftirme \u00e7al\u0131\u015fmas\u0131, kristal yap\u0131daki orijinal ligand pozisyonunun aktif yerle\u015ftirme cebi oldu\u011funu ve Amerikan ginsenginin anahtar bile\u015fikleri ile hipoksik hedef proteinler aras\u0131ndaki ba\u011flanma b\u00f6lgesinin anahtar aktif b\u00f6lge oldu\u011funu belirlemi\u015ftir. Ba\u011flanma enerjisi ne kadar d\u00fc\u015f\u00fck olursa, ligand ve hedef protein aras\u0131ndaki ba\u011flanma kabiliyeti o kadar g\u00fc\u00e7l\u00fc olur. \u00c7e\u015fitli bile\u015fiklerin hedefle kenetlenmesi yoluyla, pro-enflamatuar fakt\u00f6r TNF ve \u0131s\u0131 \u015fok proteini HSP90AA1'in, anti hipoksi i\u00e7in Amerikan ginsenginin potansiyel bir anahtar hedefi olabilecek anahtar aktif bile\u015fenlerle g\u00fc\u00e7l\u00fc bir ba\u011flanma yetene\u011fine sahip oldu\u011fu bulunmu\u015ftur. Molek\u00fcler dinamiklerle daha fazla do\u011frulama yap\u0131larak, HSP90AA1 ve ginsenosid Rg1, TNF ve ginsenosid Ro'nun dinamik sim\u00fclasyonunun, \u00e7ekirdek hedef ve bile\u015fik kompleksinin ba\u011flanma s\u0131k\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 ve kararl\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 ortaya \u00e7\u0131karan ve do\u011frulayan kararl\u0131 konformasyonlar olu\u015fturabilece\u011fi bulunmu\u015ftur. Bu, anti hipoksi etkileri i\u00e7in Amerikan ginsenginin potansiyel hipoksi hedeflerinin incelenmesi i\u00e7in g\u00fcvenilir bir teorik temel sa\u011flar.<\/p>\n
\u00d6zetle, bu \u00e7al\u0131\u015fmada Amerikan ginsenginin anti hipoksi etkisi bir zebra bal\u0131\u011f\u0131 modeli kullan\u0131larak de\u011ferlendirilmi\u015f ve a\u011f farmakolojisi teknikleri kullan\u0131larak anti hipoksi ile ilgili aktif bile\u015fenler ve \u00e7ekirdek hedefler ara\u015ft\u0131r\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r. Aktif bile\u015fenlerin ve \u00e7ekirdek hedeflerin ba\u011flanmas\u0131n\u0131 daha da do\u011frulamak i\u00e7in molek\u00fcler yerle\u015ftirme teknolojisi ve molek\u00fcler dinamikler kullan\u0131lm\u0131\u015f ve Amerikan ginsenginin anti hipoksi i\u00e7in potansiyel hedefleri ortaya \u00e7\u0131kar\u0131lm\u0131\u015ft\u0131r. Geleneksel \u00c7in t\u0131bb\u0131 bile\u015fenlerinin karma\u015f\u0131kl\u0131\u011f\u0131 ve Amerikan ginsengindeki saponinlerin molek\u00fcler yap\u0131s\u0131 nedeniyle, a\u011f farmakolojisine dayal\u0131 \u00f6n ke\u015fif hala yetersizdir. \u00c7in ve Bat\u0131 ginsenginin anti hipoksi etkilerinin \u00f6ng\u00f6r\u00fclen hedefleri ile ilgili olarak, Amerikan ginsenginin anti hipoksi farmakolojik bile\u015fenlerinin incelenmesi i\u00e7in teorik temel ve referans sa\u011flamak ve daha sonraki a\u015famada ilgili mekanizma ara\u015ft\u0131rmas\u0131 i\u00e7in bir temel sa\u011flamak amac\u0131yla daha sonraki a\u015famada daha fazla deneysel do\u011frulama yap\u0131lacakt\u0131r.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Exploring the anti hypoxia effect and potential targets of American ginseng based on zebrafish model and dynamic molecular docking technology Hypoxia is a complex pathological process caused by multiple factors, which refers to varying degrees of breathing difficulties in the body. The inability to intake sufficient oxygen through the respiratory tract leads to pathological changes […]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n