Buhur mürünün meme kanseri tedavisindeki mekanizmasının veri madenciliği ve ağ farmakolojisine dayalı olarak araştırılması
Buhur, zeytingiller familyasından Boswellia carterii Birdw. ve aynı familyadan Boswellia bhaurdajiana Birdw. bitkilerinin kabuklarından elde edilen bir reçinedir. Tadı keskin, sıcak ve acıdır ve kalp, karaciğer ve dalak meridyenlerinde bulunur. Kan dolaşımını teşvik etme, ağrıyı hafifletme, şişliği azaltma ve kas büyümesini teşvik etme etkilerine sahiptir. Mür, Burseraceae familyasındaki Euphora myrrh Engl. veya Hemiphora molmol Engl. bitkilerinden elde edilen kuru bir reçinedir. Hafif bir yapıya, keskin ve acı bir tada sahiptir ve kalp, karaciğer ve dalak meridyenleri için uygundur. Kan stazını dağıtmada, ağrıyı dindirmede, şişliği azaltmada ve kas büyümesini teşvik etmede mükemmel etkileri vardır. Buhur ve mür kombinasyonu ilk olarak "Tanı ve Tedavi Kılavuzları "nda "buhur ağrı giderici toz" olarak yer almıştır. Klinik uygulamada, bu ikisi genellikle tamamlayıcı bir biçimde kullanılır, sinerjik olarak etkinliklerini arttırır ve kan dolaşımını teşvik etmek ve kan stazını gidermek için yaygın olarak geleneksel Çin tıbbında kullanılır.
Şu anda, artrit, meme hiperplazisi ve kanser ağrısı için buhur ve mür üzerine ağ farmakolojisi çalışmaları bulunmaktadır. Bu çalışmalar sadece bileşiğin hedefi ve yolu arasındaki biyolojik süreci doğrudan yansıtmaktadır ve meme kanseri tedavisi için buhur ve mür üzerine derinlemesine bir ağ farmakolojisi ve ilgili doğrulama çalışması yoktur. "Tümör Formülleri Sözlüğü" gibi Çin tıbbı kitaplarına başvurarak, meme kanseriyle ilgili klinik tanı ve tedavi verilerini toplayarak, ilaç uyumluluk kurallarını, çekirdek ilaçları ve diğer ilişkilendirme kurallarını madencilik yoluyla, bu makale "buhur mür" ilaç çiftinin meme kanseri için Çin tıbbında kullanılan ilaçlar arasında en yüksek güvene sahip olduğu sonucuna varmıştır. Ayrıca, tütsü mürünün aktif bileşenlerini ve hedeflerini daha da netleştirmek ve meme kanseri tedavisindeki moleküler mekanizmalarını analiz etmek için tütsü mür çiftleri üzerinde ağ farmakolojisi ve moleküler yerleştirme çalışmaları yapılmıştır.
Hedef veri tabanındaki ilaç kullanım kuralının Apriori birliktelik kuralları ile analiz edilmesiyle, en yüksek güven seviyesinin meme kanserinin buhur ve mür ile eşzamanlı tedavisinde elde edildiği bulunmuştur. Güven seviyesi yükseldikçe, mür ve buhurun uyumluluk olasılığı da artmaktadır. CHAID, CRT ve QUEST yaygın olarak kullanılan üç karar ağacı tahmin yöntemidir. CHAID varsayılan olarak çok yollu bölme kullanır, bu da düğümlerdeki örneklem boyutunu azaltır ve ağacın derinliğinde bir azalmaya yol açar. CRT ikili bölme (her düğümü iki alt düğüme bölme) gerçekleştirir. CHAID sınıflandırılmış/ayrık hedeflerle kullanılmak üzere tasarlanmıştır, CRT ise regresyon ve sınıflandırma için kullanılabilir. CART ile karşılaştırıldığında CHAID, bölünmüş değişkenlerin ve bölünmüş noktaların seçiminde daha az karışıklığa sahiptir. QUEST düğümü, büyük CRT karar ağaçlarını analiz etmek için gereken işlem süresini azaltmak ve sınıflandırma ağacı yöntemlerinde birden fazla kategoriye sahip değişkenleri tahmin etmeye yönelik ortak önyargı eğilimini en aza indirmek için tasarlanmış karar ağaçları oluşturmak için ikili bir sınıflandırma yöntemi sağlayabilir. Hesaplama süreci CRT'den daha basit ve daha etkilidir ve üç yöntemin avantajları birbirini tamamlamaktadır. Karar ağacı algoritması bağımlı değişken olarak buhur alır ve CHAID, CRT ve QUEST karar ağacı algoritmalarının tümü, etken maddeler ve buhur arasında daha yüksek bir uyumluluk olasılığını tarar, bu da kan aktive edici ve staz giderici ilaçlar olarak buhur ve mürün ağaç modeli formülünün oluşturulmasına katılmak için önemli etkileri olduğunu gösterir. Buhur ilk olarak "Mingyi Bielu "da kaydedilmiştir. Sıcak bir doğası ve hafif bir tadı vardır, hoş kokulu ve akıcı bir aroması vardır. Qi'yi düzenlemede ve kan dolaşımını teşvik etmede iyidir. Mür ile ilgili en eski kayıt Song Hanedanlığı'nın "Kaibao Bencao "suna kadar uzanmaktadır. Hafif bir doğası, ince bir qi'si ve acı bir tadı vardır, kan stazını gidermeye ve kan akışını düzenlemeye odaklanır. Bu ikisi genellikle etkinliği artırmak için sinerji içinde kullanılır.
Cytoscape'teki CytoNCA eklentisi aracılığıyla buhur ve mürdeki 53 aktif bileşenin daha fazla araştırılması gerçekleştirilmiştir. Parametre derecesi sıralaması ve klinik araştırma literatürüne dayanarak, 3-metoksifuranon-9-en8-one, buhur asidi ve kuersetin gibi bileşenlerin önemli roller oynadığı bulunmuştur. Modern araştırmalar, buhurdaki en karakteristik ve kapsamlı olarak çalışılan bileşenin, pentasiklik triterpenoid sınıfına ait olan ve tümör hücreleri üzerinde anti proliferatif, farklılaşmayı indükleyici ve apoptoz etkileri olan buhur asidi (buhur asidi gibi) olduğunu göstermiştir. Özellikle, asetil frankincense asit düşük toksisiteye sahiptir ve umut verici bir anti-tümör ilacı ve tümör metastazı inhibitörüdür. Furanonlar ayrıca tümör hücresi proliferasyonunun inhibitör aktivitesini belirli bir ölçüde artırabilir. Kuersetin, çeşitli meyve ve bitkilerde bulunan, antioksidan, anti-enflamatuar ve pro apoptotik etkileri olan polifenolik bir maddedir. Araştırmalar, kuersetinin TLR-4/NF - κ B sinyal yolunu inhibe ederek inflamatuar faktörler interlökin-1 β (IL-1 β) ve tümör nekroz faktörü alfa (TNF - α) ekspresyonunu dolaylı olarak inhibe ettiğini bulmuştur.
Meme kanseri tedavisinde sığla mürünün mekanizmasını daha fazla araştırmak için anahtar hedeflerin GO fonksiyonu ve KEGG yolu zenginleştirme analizi gerçekleştirilmiştir. GO üç işlevsel bilgi içerir: genlerin dahil olduğu biyolojik süreç, sahip olduğu hücre bileşenleri ve oynadığı moleküler işlevler. Sonuçlar, sığla mürünün PI3K Akt sinyal yolunu, Östrojen sinyal yolunu, MikroRNA'ları, RNA polimeraz II promotör transkripsiyonunun pozitif/negatif düzenlenmesi, transkripsiyon/DNA şablonu, çekirdek, sitoplazma dahil 60 hücre bileşeni ve protein bağlanması, poli (A) RNA bağlanması ve enzim bağlanması dahil 94 moleküler reaksiyon dahil 248 biyolojik sürece katılarak düzenleyebileceğini göstermiştir. Kanser, MAPK sinyal yolu ve P53 sinyal yolu anti-tümör rolü oynamaktadır. Anahtar genler, meme kanserinin buhur mür ile tedavisinde büyük öneme sahiptir. Cytoscape'teki cytoHubba eklentisi, en yüksek derece değerine sahip çekirdek genleri taramak için kullanılmıştır. İlgili referanslara ve KEGG zenginleştirme analizindeki anahtar yollara göre, iki etkili eylem yolu Kanserde mikroRNA'lar ve MAPK sinyal yolları taranmıştır. Bu iki yolakta zenginleştirilmiş çekirdek genler CREBBP, GRB2, HNRNPK, YWHAE ve YWHAG'dir. MikroRNA'ların kanser yolunda anormal ekspresyonu ve meme kanserinin anjiyogenezi, tümör hücresi metastazı, invazyonu ve tümör ilaç direnci. Süreç yakından ilişkilidir ve miRNA'lar meme kanseri için erken tanı göstergeleri olarak kullanılabilir ve meme kanseri için etkili terapötik ilaçlar haline gelebilir. Araştırmalar, mürdeki mür steroidlerinin miRNA'ların ifadesini düzenleyerek ve belirli anahtar hedef proteinlerin aktivitesini etkileyerek anti-tümör etkiler de gösterebileceğini göstermiştir. MAPK, hücrelerde yaygın olarak bulunan bir serin/treonin protein kinazdır. MAPK sinyal yolu hücre çoğalmasına, apoptoza, otofajiye katılır ve dirençle ilgili genlerin ve proteinlerin ekspresyonunu düzenler. MAPK sinyal yoluna müdahale, kemoterapi ilaçlarına karşı tümör duyarlılığını artırabilir ve ilaç direncini tersine çevirebilir. Çalışmalar, mürdeki β - elemenin de iyi bir anti-tümör etkinliğine sahip olduğunu ve glioblastoma üzerindeki anti proliferatif etkisinin MAPK sinyal yolunu aktive ederek elde edildiğini göstermiştir. YWHAE, tümörlerin oluşumu ve gelişimi ile yakından ilişkilidir ve esas olarak tümör hücre döngüsü, büyüme ve apoptoz, difüzyon ve göç ve sinyal iletimi gibi yolaklarda rol oynar. CREBBP, transkripsiyonel bir koaktivatör olarak çeşitli hücre fonksiyonlarına katılabilir ve tümörü inhibe edebilir. Mutasyonu yumurtalık kanseri, foliküler lenfoma ve meme kanseri insidans oranını artırabilir. GRB2, hücrelerde yaygın olarak ifade edilen bir adaptör proteindir ve anormal ifadesi veya aktivasyonu tümörlerin oluşumuyla yakından ilişkilidir. Çalışmalar, anti-tümör tedavisi için moleküler bir hedef olarak hizmet edebileceğini göstermiş ve GRB2 inhibitörlerini anti-tümör ilaçlarının geliştirilmesinde sıcak bir konu haline getirmiştir. YWHAG, protein lokalizasyonu ve taşınması, hücre içi sinyalizasyon, hücre döngüsü düzenlemesi ve apoptozda rol oynayan bir tirozin 3-monooksijenaz / triptofan 5-monooksijenaz aktive edici protein gama peptididir (14-3-3 γ). HNRNPK geni hücrelerin sitoplazmasında ve/veya çekirdeğinde dağılabilir ve tümörlerde çoklu onkogenlerin ve tümör baskılayıcı genlerin ekspresyonunun düzenlenmesine katılarak farklı hücre altı yapılardaki çeşitli proteinlerle etkileşime girebilir.
Ağ farmakolojisi sonuçlarının güvenilirliğini daha da doğrulamak amacıyla, çekirdek bileşenler ve ana hedefler üzerinde ayrı ayrı moleküler yerleştirme gerçekleştirmek için moleküler yerleştirme teknolojisi kullanılmıştır. Sonuçlar, çekirdek bileşenler 3-metoksifuran-guanozin-9-en-8-on, sığla asidi ve kuersetinin CREBBP, GRB2, HNRNPK, YWHAE ve YWHAG hedefleri ile bağlanma enerjilerinin -5.0 kcal/mol'den düşük olduğunu göstererek iyi bağlanma aktivitelerine işaret etmiştir. Mastik asit ve GRB2'nin bağlanma enerjisinin -9.1kcal/mol olması, güçlü bağlanma aktivitesine sahip olduklarını göstermekte ve GRB2'nin meme kanseri tedavisinde rol oynayabilecek önemli bir sakız mürü hedefi olduğunu düşündürmektedir.
Özetle, bu makale "bileşik hedef hastalık" ile ilgili bir ağ oluşturmak için ağ farmakolojisi yöntemini kullanmakta ve tütsü mür bileşenleri, hedefler ve sinyal yolları arasındaki etkileşim ilişkisini bir bütün olarak analiz etmektedir. Buhur ve mürün meme kanserine karşı mekanizmasını doğrulamak için moleküler yerleştirme teknolojisi kullanılmıştır. Buhur ve mürün, 3-metoksiguanozil-9-en-8-on, mastik asit, kuersetin ve diğer bileşenler aracılığıyla CREBBP, GRB2, HNRNPK, YWHAE, YWHAG ve diğer hedefler üzerinde sinerjik olarak etki edebileceği ve kanser yolağındaki MikroRNA'lar aracılığıyla MAPK sinyal yolağının hücre proliferasyonunda rol oynadığı tahmin edilmektedir, apoptoz, otofaji süreci ve ilaca dirençli ilgili genlerin düzenlenmesi, buhur ve mür mekanizmasının çok bileşenli, çok hedefli ve çok yollu bir anti-kanser rolü oynadığını göstermektedir. Daha sonra, bu alt hedefli yerleştirme sanal tarama çalışmasının sonuçlarını doğrulamak ve meme kanseri tedavisi için ilaçların araştırılması ve geliştirilmesi için yeni bir yön ve temel sağlayarak temel etki mekanizmasını daha fazla keşfetmek için tütsü mür çiftleri üzerinde deneysel çalışmalar yapılabilir.