T\u00f6megspektrometri\u00e1s molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatok alkalmaz\u00e1sa a term\u00e9szetes term\u00e9kek szerkezet\u00e9nek vizsg\u00e1lat\u00e1ban
\nA vegy\u00fcletek szerkezeti elemz\u00e9se kulcsfontoss\u00e1g\u00fa a term\u00e9szetes term\u00e9kek felfedez\u00e9s\u00e9hez, k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen a ritka vagy \u00e9rt\u00e9kes k\u00ednai gy\u00f3gy\u00e1szati anyagok anyagi alapjainak felt\u00e1r\u00e1s\u00e1hoz. A rendk\u00edv\u00fcl v\u00e1ltozatos vegy\u00fcletszerkezetek elemz\u00e9se azonban jelent\u0151s mennyis\u00e9g\u0171 id\u0151t \u00e9s munkaer\u0151t ig\u00e9nyel, ami az egyik legnagyobb kih\u00edv\u00e1s a term\u00e9szetes term\u00e9kek jellemz\u00e9s\u00e9ben. Ez\u00e9rt a t\u00f6megspektrometri\u00e1s molekulah\u00e1l\u00f3zati technol\u00f3gi\u00e1t alkalmazz\u00e1k a term\u00e9szetes term\u00e9kek szerkezeti kutat\u00e1s\u00e1ra.<\/p>\n
A folyad\u00e9kkromatogr\u00e1fi\u00e1s tandem t\u00f6megspektrometria (LC-MS\/MS) az egyik leggyakrabban haszn\u00e1lt analitikai m\u00f3dszer a metabolizmusban, azonban ezeknek a komplex adatoknak az \u00e9rtelmez\u00e9se nagy kih\u00edv\u00e1st jelent a term\u00e9szetes term\u00e9kek kutat\u00e1s\u00e1ban. Az elm\u00falt \u00e9vekben az \u00faj bioinformatikai m\u00f3dszerek, p\u00e9ld\u00e1ul a molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatok megjelen\u00e9se \u00faj \u00f6tleteket \u00e9s perspekt\u00edv\u00e1kat ny\u00fajtott az ismert vegy\u00fcletek komplex m\u00e1trixokban t\u00f6rt\u00e9n\u0151 felismer\u00e9s\u00e9hez. A Glob\u00e1lis Term\u00e9szetes Term\u00e9kek T\u00e1rsadalmi Molekul\u00e1ris H\u00e1l\u00f3zat (GNPS) a tandem t\u00f6megspektrometri\u00e1s adatok ny\u00edlt adatb\u00e1zisa, amely jelenleg az egyetlen olyan nyilv\u00e1nos alapoz\u00f3 platform, amely k\u00e9pes molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatok megval\u00f3s\u00edt\u00e1s\u00e1ra \u00e9s LC-MS\/MS \u00e1ltal gener\u00e1lt adathalmazok elemz\u00e9s\u00e9re. A GNPS-ben a molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatok vizualiz\u00e1ci\u00f3ja minden spektrumot csom\u00f3pontk\u00e9nt \u00e1br\u00e1zol, a spektrumok spektrumokhoz val\u00f3 rendez\u00e9se pedig a csom\u00f3pontok k\u00f6z\u00f6tti kapcsolatokat jelenti. A GNPS-ben a relev\u00e1ns molekul\u00e1ris spektrumok molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatokk\u00e9nt online vizualiz\u00e1lhat\u00f3k. A GNPS \u00f6sszesen 235850 spektrumot \u00e9s 22644 vegy\u00fcletet tartalmaz. A GNPS nemcsak az ismert vegy\u00fcletek, anal\u00f3gok azonos\u00edt\u00e1s\u00e1t \u00e9s a vegy\u00fcletek automatikus elemz\u00e9s\u00e9t teszi lehet\u0151v\u00e9 molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatokban, hanem k\u00e9pes t\u00f6bb forr\u00e1sb\u00f3l sz\u00e1rmaz\u00f3 m\u00e1sodlagos t\u00f6megspektrometri\u00e1s adatok replik\u00e1l\u00e1s\u00e1ra, \u00f6sszekapcsol\u00e1s\u00e1ra \u00e9s t\u00e1rol\u00e1s\u00e1ra is.<\/p>\n
A molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zat (MN) egy platform az MS\/MS adatok szervez\u00e9s\u00e9re \u00e9s vizualiz\u00e1l\u00e1s\u00e1ra. Minden t\u00f6megspektrumot vektornak tekint\u00fcnk, \u00e9s az \u00f6sszes t\u00f6bbi t\u00f6megspektrummal \u00f6sszehasonl\u00edtjuk a koszinusz hasonl\u00f3s\u00e1g seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel. Ha k\u00e9t t\u00f6megspektrum k\u00f6z\u00f6tti hasonl\u00f3s\u00e1g meghalad egy k\u00fcsz\u00f6b\u00e9rt\u00e9ket, akkor a molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zatban \u00f6sszekapcsol\u00f3dnak. Pieter professzor 2012-ben javasolta el\u0151sz\u00f6r a molekulah\u00e1l\u00f3zati technol\u00f3gi\u00e1t. A t\u00f6megspektrometri\u00e1s molekul\u00e1ris h\u00e1l\u00f3zat egy tandem t\u00f6megspektrometri\u00e1s anal\u00edzisen (MS\/MS) alapul\u00f3 m\u00f3dszer, amely alkalmas k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 term\u00e9szetes term\u00e9kek elemz\u00e9s\u00e9re. C\u00e9lja az ismert vegy\u00fcletek gyors azonos\u00edt\u00e1sa \u00e9s a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 ismeretlen term\u00e9szetes term\u00e9kek meghat\u00e1roz\u00e1sa. R\u00f6viden, ez a m\u00f3dszer a tandem t\u00f6megspektrometri\u00e1s adatok \u00f6sszegy\u0171jt\u00e9s\u00e9t \u00e9s a fragmentumok hasonl\u00f3s\u00e1g\u00e1n alapul\u00f3 h\u00e1l\u00f3zat fel\u00e9p\u00edt\u00e9s\u00e9t foglalja mag\u00e1ban. Ezt a technol\u00f3gi\u00e1t sz\u00e9les k\u00f6rben alkalmazz\u00e1k olyan ter\u00fcleteken, mint a term\u00e9szetes term\u00e9kek, a metabolizmus \u00e9s a gy\u00f3gyszerkutat\u00e1s.<\/p>\n
Jelenleg Trivella et al. \u00e9s Fox Ramos et al. arr\u00f3l sz\u00e1moltak be, hogy az MN rendk\u00edv\u00fcl hat\u00e9kony eszk\u00f6znek bizonyult a term\u00e9szetes term\u00e9kek gyors azonos\u00edt\u00e1s\u00e1ra komplex kever\u00e9kekben \u00e9s \u00faj term\u00e9szetes term\u00e9kek felfedez\u00e9s\u00e9nek seg\u00edt\u00e9s\u00e9re; Nothias Esposito et al. arr\u00f3l sz\u00e1moltak be, hogy az MN hat\u00e9kony eszk\u00f6z a n\u00f6v\u00e9nyekben a specifikus metabolitok keletkez\u00e9s\u00e9nek jellemz\u00e9s\u00e9re a t\u00f6megspektrometri\u00e1n alapul\u00f3 metabolizmusban; Kang et al. az MN-t a m\u00e1sodlagos metabolitok hasonl\u00f3 klaszterekbe t\u00f6rt\u00e9n\u0151 oszt\u00e1lyoz\u00e1s\u00e1ra haszn\u00e1lta, amit a term\u00e9szetes term\u00e9k kutat\u00e1sban a c\u00e9lpontok sz\u0171r\u00e9s\u00e9re \u00e9s izol\u00e1l\u00e1s\u00e1ra haszn\u00e1ltak; Lei et al. MN seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9geket figyelt meg a feldolgozatlan \u00e9s a feldolgozott akonit tartalm\u00e1ban; Tian et al. tov\u00e1bb\u00e1 arr\u00f3l sz\u00e1molt be, hogy az MN seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel egy\u00e9rtelm\u0171en megfigyelhet\u0151k a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 fajt\u00e1kb\u00f3l \u00e9s eredet\u0171 te\u00e1k k\u00e9miai \u00f6sszet\u00e9tel\u00e9nek k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9gei, \u00edgy lehet\u0151v\u00e9 v\u00e1lik a tea min\u0151s\u00e9gi \u00e9s mennyis\u00e9gi \u00e9rt\u00e9kel\u00e9se; A fragmentionok t\u00edpusainak \u00e9s a fragmentionok relat\u00edv tartalmi v\u00e1ltoz\u00e1sainak elemz\u00e9s\u00e9vel k\u00f6vetkeztetni lehet a term\u00e9szetes term\u00e9kek molekul\u00e1ris szerkezet\u00e9nek v\u00e1ltoz\u00e1saira \u00e9s funkcion\u00e1lis csoportjaik \u00e1talakul\u00e1s\u00e1ra, hogy meg\u00e1llap\u00edthat\u00f3 legyen, hogy a term\u00e9szetes term\u00e9kek keletkeztek-e vagy \u00e1talakultak.<\/p>\n
<\/p>\n
Az elm\u00falt n\u00e9h\u00e1ny \u00e9vben az MN-t a term\u00e9szetes term\u00e9kek szerkezeti kutat\u00e1s\u00e1nak egyszer\u0171s\u00edt\u00e9s\u00e9re szolg\u00e1l\u00f3 \u00faj eszk\u00f6zk\u00e9nt javasolt\u00e1k, \u00e9s sikeresen alkalmazt\u00e1k a term\u00e9szetes term\u00e9kek k\u00e9miai \u00e9s akt\u00edv \u00f6sszetev\u0151inek felfedez\u00e9s\u00e9re, elv\u00e1laszt\u00e1s\u00e1ra, el\u0151\u00e1ll\u00edt\u00e1s\u00e1ra, szerkezeti azonos\u00edt\u00e1s\u00e1ra \u00e9s mennyis\u00e9gi elemz\u00e9s\u00e9re. Az MN alkalmas a term\u00e9szetes term\u00e9kek in vivo \u00f6sszet\u00e9tel\u00e9nek \u00e9s metabolitjainak tanulm\u00e1nyoz\u00e1s\u00e1ra, ami jobban megvil\u00e1g\u00edthatja farmakol\u00f3giai anyagalapjukat \u00e9s metabolikus folyamataikat.<\/p>\n
Az MN seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel a jellegzetes fragmentumionok \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1sa, valamint t\u00edpusaik \u00e9s relat\u00edv tartalmi v\u00e1ltoz\u00e1suk elemz\u00e9se r\u00e9v\u00e9n k\u00f6vetkeztethet\u00fcnk a term\u00e9szetes term\u00e9kek molekulaszerkezeti v\u00e1ltoz\u00e1saira \u00e9s funkci\u00f3s csoport \u00e1talakul\u00e1saira, amelyekb\u0151l k\u00f6vetkeztethet\u00fcnk a term\u00e9szetes term\u00e9kek bioszintetikus \u00fatvonalaira. Az irodalomkutat\u00e1s azonban azt tal\u00e1lta, hogy nem sok vonatkoz\u00f3 jelent\u00e9s van itthon \u00e9s k\u00fclf\u00f6ld\u00f6n, ami \u00faj ir\u00e1nyt jelenthet az MN sz\u00e1m\u00e1ra a term\u00e9szetes term\u00e9kek kutat\u00e1s\u00e1ban.<\/p>\n
\u00d6sszefoglalva, eddig az MN-t els\u0151sorban a term\u00e9szetes term\u00e9kek szerkezeti azonos\u00edt\u00e1s\u00e1ra alkalmazt\u00e1k. M\u00e1s technol\u00f3gi\u00e1kkal kombin\u00e1lva hat\u00e9kony \u00e9s gyors m\u00f3dszer a term\u00e9szetes term\u00e9kek szerkezeti kutat\u00e1s\u00e1ra, k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen az \u00faj szerkezetek \u00e9s hat\u00f3anyagok felfedez\u00e9s\u00e9re. Viszonylag kev\u00e9s kutat\u00e1s foglalkozik a metabolizmussal, a mennyis\u00e9gi elemz\u00e9ssel \u00e9s a bioszintetikus \u00fatvonalakkal a szervezetben, ami egy olyan ir\u00e1ny, amelyre a kutat\u00f3k a j\u00f6v\u0151ben \u00f6sszpontos\u00edthatnak.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Application of Mass Spectrometry Molecular Networks in the Study of Natural Product Structures The structural analysis of compounds is crucial for the discovery of natural products, especially for revealing the material basis of rare or precious Chinese medicinal materials. However, the analysis of highly diverse compound structures requires a significant amount of time and manpower, […]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n