Exploration du m\u00e9canisme potentiel du m\u00e9dicament Jingjie Fangfeng dans le traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus sur la base de la pharmacologie de r\u00e9seau et du docking mol\u00e9culaire
\nEn d\u00e9cembre 2019, une nouvelle pneumonie caus\u00e9e par un nouveau coronavirus (SARS CoV-2) a \u00e9clat\u00e9 \u00e0 Wuhan. Les principaux sympt\u00f4mes des patients sont la fi\u00e8vre, la fatigue et la toux s\u00e8che. Dans les cas graves, ils \u00e9voluent rapidement vers un syndrome de d\u00e9tresse respiratoire aigu\u00eb, un choc septique, une acidose m\u00e9tabolique difficile \u00e0 corriger et des troubles de la coagulation. \u00c0 la date du 26 mai 2020 \u00e0 24 heures, la Chine a signal\u00e9 un total de 82993 cas confirm\u00e9s, dont 79 cas confirm\u00e9s (y compris 5 cas graves), 78280 cas gu\u00e9ris et sortis de l'h\u00f4pital, et 4634 d\u00e9c\u00e8s. Dans le m\u00eame temps, l'incidence des infections \u00e0 l'\u00e9tranger continue d'augmenter, avec un total de plus de 5,5 millions de cas confirm\u00e9s. Il s'agit de la troisi\u00e8me \u00e9pid\u00e9mie de coronavirus \u00e0 grande \u00e9chelle en seulement 20 ans au XXIe si\u00e8cle, apr\u00e8s le syndrome respiratoire aigu s\u00e9v\u00e8re (SRAS) en 2003 et le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) en 2015. Le coronavirus constitue une menace s\u00e9rieuse pour la sant\u00e9 humaine chaque fois qu'il se propage \u00e0 grande \u00e9chelle, ce qui pose de graves probl\u00e8mes et p\u00e8se lourdement sur le d\u00e9veloppement social et \u00e9conomique. Cependant, il n'existe actuellement aucun m\u00e9dicament sp\u00e9cifique pour traiter la pneumonie caus\u00e9e par le coronavirus dans la pratique clinique, et un traitement de soutien est principalement utilis\u00e9. Il est donc urgent de mener des recherches sur des m\u00e9dicaments apparent\u00e9s.<\/p>\n
Depuis l'apparition de l'\u00e9pid\u00e9mie de nouveau coronavirus, conform\u00e9ment aux plans de diagnostic et de traitement et aux recommandations des provinces, des villes et des r\u00e9gions autonomes, la m\u00e9decine chinoise a \u00e9t\u00e9 largement utilis\u00e9e dans le traitement du nouveau coronavirus, et de nombreuses provinces et villes recommandent l'utilisation de Schizonepeta tenuifolia et de Fangfeng dans la m\u00e9decine traditionnelle chinoise. Schizonepetae Herba (SH) est la partie a\u00e9rienne s\u00e8che de Nepeta cataria L., une plante de la famille des Lamiaceae. Elle a un go\u00fbt piquant, une nature l\u00e9g\u00e8rement chaude et a pour effet de soulager les sympt\u00f4mes externes, de disperser le vent, de p\u00e9n\u00e9trer les \u00e9ruptions cutan\u00e9es et d'\u00e9liminer les plaies. Saposhnikoviae Radix (SR) est une esp\u00e8ce v\u00e9g\u00e9tale de la famille des ombellif\u00e8res, Saposhnikovia divaricata (Trucz.) Schischk Racines s\u00e8ches, au go\u00fbt piquant et sucr\u00e9, de nature l\u00e9g\u00e8rement chaude. Elle a pour effet de chasser le vent, de soulager la douleur, de dissiper l'humidit\u00e9 et d'arr\u00eater les spasmes. Jingjie et Fangfeng sont les m\u00e9dicaments royaux de Fangfeng Tongsheng Wan mentionn\u00e9s dans le Xuanming Lun Fang. Dans le Shi Jin Mo Yao Dui, les deux sont pr\u00e9sent\u00e9s comme une paire de m\u00e9dicaments permettant de disperser le vent et le froid, de dissiper le vent et de supprimer l'humidit\u00e9. Jingjie et Fangfeng ont tous deux des effets antipyr\u00e9tiques, analg\u00e9siques, s\u00e9datifs, antibact\u00e9riens, anti-inflammatoires, h\u00e9mostatiques et autres.<\/p>\n
Depuis sa proposition en 2008, la pharmacologie de r\u00e9seau est devenue une discipline \u00e9mergente qui r\u00e9v\u00e8le syst\u00e9matiquement les effets de r\u00e9seau r\u00e9glementaires de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise sur l'organisme. Gr\u00e2ce \u00e0 ses m\u00e9thodes de recherche holistiques et syst\u00e9matiques et \u00e0 l'accent mis sur les interactions m\u00e9dicamenteuses, qui sont compatibles avec les caract\u00e9ristiques multi-cibles et multi-voies de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise, elle est devenue un outil efficace pour analyser syst\u00e9matiquement les m\u00e9canismes multi-cibles et multi-voies des formules de m\u00e9decine traditionnelle chinoise. De nombreuses \u00e9tudes ont explor\u00e9 avec succ\u00e8s le m\u00e9canisme d'action de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise \u00e0 l'aide de la pharmacologie de r\u00e9seau. En r\u00e9sum\u00e9, cet article vise \u00e0 explorer le m\u00e9canisme potentiel du traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus en utilisant la pharmacologie de r\u00e9seau et les m\u00e9thodes de docking mol\u00e9culaire, et \u00e0 fournir une r\u00e9f\u00e9rence pour l'application clinique de Jingjie Fangfeng. Tout d'abord, les ingr\u00e9dients actifs et leurs cibles dans Schizonepeta tenuifolia ont \u00e9t\u00e9 collect\u00e9s en recherchant dans les bases de donn\u00e9es TCMSP, ETCM et BATMAN-TCM, et les cibles li\u00e9es \u00e0 la pneumonie \u00e0 coronavirus ont \u00e9t\u00e9 collect\u00e9es dans les bases de donn\u00e9es GeneCards, OMIM et NCBI Gene. Ensuite, l'intersection des deux a \u00e9t\u00e9 analys\u00e9e \u00e0 l'aide de la base de donn\u00e9es STRING pour \u00e9tudier les interactions prot\u00e9iques entre les cibles cl\u00e9s, et la base de donn\u00e9es DAVID a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9e pour l'analyse de la fonction biologique et des voies d'acc\u00e8s. Enfin, le logiciel Autodock a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9 pour l'ancrage mol\u00e9culaire des substances pharmacologiques potentielles et des cibles cl\u00e9s.<\/p>\n
Le Jingjie et le Fangfeng sont des m\u00e9dicaments traditionnels chinois courants destin\u00e9s \u00e0 dissiper le vent, \u00e0 soulager la chaleur superficielle, \u00e0 dissiper la chaleur et \u00e0 r\u00e9duire la fi\u00e8vre. Ils ont des effets pharmacologiques tels qu'anti-inflammatoires, antibact\u00e9riens, antiviraux et antipyr\u00e9tiques. Depuis l'apparition de la nouvelle \u00e9pid\u00e9mie de coronavirus, Schizonepeta tenuifolia et Saposhnikovia divaricata ont \u00e9t\u00e9 largement utilis\u00e9s dans le traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus. Ils ont une efficacit\u00e9 clinique relativement satisfaisante et am\u00e9liorent le taux de gu\u00e9rison clinique. Toutefois, leur m\u00e9canisme d'action n'est pas clair et la recherche exp\u00e9rimentale au niveau mol\u00e9culaire est insuffisante. Par cons\u00e9quent, la recherche et l'analyse approfondies du m\u00e9canisme d'action du Jingjie Fangfeng dans le traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus, l'exploration de ses cibles potentielles, fournissent une orientation pour la recherche ult\u00e9rieure sur le m\u00e9canisme mol\u00e9culaire du Jingjie Fangfeng et sont d'une grande importance pour l'application clinique. Cet article s'appuie sur la pharmacologie de r\u00e9seau et la technologie d'ancrage mol\u00e9culaire pour \u00e9tudier les principes actifs, les cibles potentielles et les voies d'action de Jingjie Fangfeng dans le traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus. Il a \u00e9t\u00e9 constat\u00e9 que le m\u00e9dicament Jingjie Fangfeng peut agir sur des cibles telles que IL6, TNF, MAPK1, IL1 \u03b2, TP53 par le biais de produits actifs tels que la lut\u00e9oline, la querc\u00e9tine, la wogonine, le b\u00eata sitost\u00e9rol, etc., en r\u00e9gulant des processus biologiques tels que la r\u00e9ponse \u00e0 l'inflammation, la r\u00e9gulation positive de la transcription du promoteur de l'ARN polym\u00e9rase II, la r\u00e9ponse immunitaire et la r\u00e9gulation n\u00e9gative de l'apoptose. Il exerce des effets pharmacologiques multicomposants, multicibles et multicanaux contre la pneumonie \u00e0 coronavirus par le biais de la voie de signalisation du TNF, de la voie de signalisation PI3K Akt, de l'interaction cytokine-r\u00e9cepteur de cytokine, de la voie de signalisation MAPK, de la voie de signalisation HIF-1, de la voie de signalisation du r\u00e9cepteur Toll like, de la voie de signalisation du r\u00e9cepteur des lymphocytes T, etc.<\/p>\n
Les param\u00e8tres du r\u00e9seau PPI montrent que les valeurs de degr\u00e9 de 23 prot\u00e9ines, dont IL6, TNF, MAPK1, TP53, IL1 \u03b2, RELA et IL10, sont sup\u00e9rieures \u00e0 la moyenne, ce qui indique qu'elles sont \u00e9troitement li\u00e9es \u00e0 d'autres prot\u00e9ines et qu'elles ont de fortes interactions dans le r\u00e9seau PPI. Parmi elles, les prot\u00e9ines li\u00e9es aux facteurs inflammatoires, telles que IL6, IL1 \u03b2, TNF et IL10, ont des valeurs de degr\u00e9 \u00e9lev\u00e9es et sont situ\u00e9es au centre du r\u00e9seau. Ces prot\u00e9ines cibles sont impliqu\u00e9es dans la r\u00e9ponse immunitaire et le processus inflammatoire des maladies respiratoires, et sont \u00e9troitement li\u00e9es \u00e0 la stimulation des voies respiratoires par la r\u00e9ponse inflammatoire. Une r\u00e9cente \u00e9tude autopsique sur les restes de patients atteints de pneumonie \u00e0 coronavirus a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 des l\u00e9sions pulmonaires importantes et des l\u00e9sions inflammatoires claires, ce qui indique que l'inflammation joue un r\u00f4le important dans le d\u00e9veloppement de la maladie. Le Jingjie Fangfeng pourrait exercer des effets anti-inflammatoires par le biais de ces cibles. Kindrachuk et al. ont d\u00e9couvert que les inhibiteurs ciblant les voies de signalisation MAPK et PI3K Akt inhibent la r\u00e9plication du coronavirus avant et apr\u00e8s l'infection virale. Les r\u00e9sultats de l'enrichissement KEGG ont \u00e9galement montr\u00e9 des diff\u00e9rences statistiques dans l'enrichissement des voies de signalisation MAPK et PI3K Akt. La voie de signalisation HIF-1 joue \u00e9galement un r\u00f4le important dans le maintien de l'hom\u00e9ostasie des cellules \u00e9pith\u00e9liales alv\u00e9olaires et dans la pathogen\u00e8se des maladies, ce qui correspond aux r\u00e9sultats de l'enrichissement de la voie KEGG. Cela indique que les substances actives de la m\u00e9decine Jingjie Fangfeng peuvent exercer des effets pharmacologiques contre la pneumonie \u00e0 coronavirus par le biais de la voie de signalisation MAPK, de la voie de signalisation PI3K Akt et de la voie de signalisation HIF-1.<\/p>\n
Gr\u00e2ce au criblage pharmacologique en r\u00e9seau, nous avons constat\u00e9 que les compos\u00e9s lut\u00e9oline, querc\u00e9tine, wogonine et b\u00eata sitost\u00e9rol ont des valeurs mod\u00e9r\u00e9es sup\u00e9rieures \u00e0 la moyenne dans le r\u00e9seau \"component target pathway\" (composant de la voie cible). Les r\u00e9sultats ont montr\u00e9 que les \u00e9nergies d'ancrage de ces quatre composants avec IL6, TNF, MAPK1 et IL1 \u03b2 \u00e9taient toutes inf\u00e9rieures \u00e0 -5 kcal\/mol, et que l'\u00e9nergie d'ancrage du b\u00eata-sitost\u00e9rol avec TP53 \u00e9tait inf\u00e9rieure \u00e0 -0,5 kcal\/mol. Cela indique que les composants chimiques actifs du Schizonepeta tenuifolia peuvent se lier de mani\u00e8re stable aux prot\u00e9ines IL6, IL1 \u03b2, TNF et TP53. Par ailleurs, des \u00e9tudes ont montr\u00e9 que la lut\u00e9oline, la querc\u00e9tine, la wogonine et le b\u00eata sitost\u00e9rol pr\u00e9sentent tous une bonne activit\u00e9 anti-inflammatoire, ce qui indique que ces composants jouent un r\u00f4le important dans l'effet anti-inflammatoire du m\u00e9dicament Jingjie Fangfeng. \u00c9tant donn\u00e9 que le COVID-19 est une nouvelle maladie et que les cibles de la maladie ne sont pas enti\u00e8rement incluses, nous avons valid\u00e9 l'ancrage des composants chimiques ayant des valeurs de degr\u00e9 sup\u00e9rieures \u00e0 la moyenne avec l'ACE2 du virus du SRAS et la prot\u00e9ase principale du COVID-19, et nous avons constat\u00e9 que les quatre produits chimiques obtenaient de bons r\u00e9sultats d'ancrage avec l'ACE2 et la prot\u00e9ase principale du COVID-19. Cela indique que la substance active du Jingjie Windproof peut se lier \u00e0 ces deux prot\u00e9ines pour exercer des effets anti-pneumonie \u00e0 coronavirus.<\/p>\n
En r\u00e9sum\u00e9, cette \u00e9tude a utilis\u00e9 des m\u00e9thodes d'analyse pharmacologique en r\u00e9seau pour \u00e9tudier les substances actives et les cibles du Jingjie Fangfeng dans le traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus, et a valid\u00e9 les cibles s\u00e9lectionn\u00e9es gr\u00e2ce \u00e0 la technologie d'ancrage mol\u00e9culaire. Parall\u00e8lement, les substances actives ont \u00e9t\u00e9 arrim\u00e9es au r\u00e9cepteur ACE2 du virus du SRAS et \u00e0 la prot\u00e9ase principale COVID-19, et le potentiel anti-coronavirus de Jingjie Fangfeng a \u00e9t\u00e9 d\u00e9couvert. Ces r\u00e9sultats soutiennent l'application clinique et le d\u00e9veloppement de Jingjie Fangfeng et jettent les bases du criblage ult\u00e9rieur des substances actives et de la recherche sur les cibles de Jingjie Fangfeng par le groupe de recherche.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Exploration du m\u00e9canisme potentiel du m\u00e9dicament Jingjie Fangfeng dans le traitement de la pneumonie \u00e0 coronavirus sur la base de la pharmacologie de r\u00e9seau et du docking mol\u00e9culaire En d\u00e9cembre 2019, une nouvelle pneumonie \u00e0 coronavirus caus\u00e9e par un nouveau coronavirus (SARS CoV-2) s'est d\u00e9clar\u00e9e \u00e0 Wuhan. Les principaux sympt\u00f4mes des patients sont la fi\u00e8vre, la fatigue et la toux s\u00e8che. Les patients s\u00e9v\u00e8res \u00e9prouvent souvent des difficult\u00e9s \u00e0 respirer et\/ou [...]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n