Pr\u00e9diction de l'ancrage mol\u00e9culaire de trois composants actifs de Solidago esculenta contre un nouveau coronavirus
\nEn d\u00e9cembre 2019, le nouveau coronavirus SARS CoV-2 s'est rapidement d\u00e9clar\u00e9 \u00e0 Wuhan, dans la province du Hubei. Au 22 juin 2020, 85018 cas confirm\u00e9s de nouvelle maladie \u00e0 coronavirus 2019 (COVID-19) ont \u00e9t\u00e9 recens\u00e9s en Chine, dont 4646 d\u00e9c\u00e8s. Par la suite, plus de 8,97 millions de cas d'infection ont \u00e9t\u00e9 signal\u00e9s dans plus de 200 pays \u00e0 travers le monde, notamment aux \u00c9tats-Unis, en Italie, en Espagne, au Royaume-Uni, en France, en Allemagne, en Iran, en Suisse, en Cor\u00e9e du Sud et au Japon. Les sympt\u00f4mes courants des patients infect\u00e9s par le SRAS-CoV-2 sont la fi\u00e8vre, la toux et les douleurs musculaires ou la fatigue. La prot\u00e9ine S du SRAS-CoV-2 est structurellement similaire \u00e0 celle du SRAS-CoV, et toutes deux ont une grande affinit\u00e9 de liaison avec l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) \u00e0 la surface des cellules humaines, qui p\u00e9n\u00e8tre dans le corps humain par l'interm\u00e9diaire de l'ACE2. L'ACE2 est largement exprim\u00e9e dans les tissus et les cellules tels que les poumons, le tube digestif et les reins, et l'on pense actuellement qu'elle est la cl\u00e9 de la p\u00e9n\u00e9tration du SARS-CoV-2 dans les cellules de l'h\u00f4te. Le traitement clinique a montr\u00e9 que la m\u00e9decine traditionnelle chinoise combin\u00e9e \u00e0 la m\u00e9decine occidentale a des effets th\u00e9rapeutiques significatifs sur le COVID-19. Jusqu'\u00e0 pr\u00e9sent, il n'existe toujours pas de m\u00e9dicaments sp\u00e9cifiques pour le traitement du COVID-19. Il est donc urgent de trouver des m\u00e9dicaments antiviraux efficaces pour enrayer cette maladie.
\nLa plante Paris polyphylla de la famille des Liliaceae, \u00e9galement connue sous le nom de \"repos des puces\", \"chariot de rivi\u00e8re\" et \"lis blanc\", poss\u00e8de une racine et une tige appel\u00e9es \"Paris polyphylla\". Le chonglou, qui est un rem\u00e8de traditionnel chinois utilis\u00e9 depuis longtemps, a des effets anti-inflammatoires, h\u00e9mostatiques, bact\u00e9ricides, s\u00e9datifs, analg\u00e9siques, antiasthmatiques et antitussifs. La m\u00e9decine populaire l'utilise \u00e9galement pour traiter divers types de plaies, d'escarboucles, de morsures de serpents venimeux, etc. Depuis les ann\u00e9es 1970, la recherche sur les ingr\u00e9dients actifs des b\u00e2timents lourds s'est poursuivie. \u00c0 l'heure actuelle, plus d'une centaine de composants chimiques ont \u00e9t\u00e9 d\u00e9couverts dans les b\u00e2timents lourds, dont plus de 70 sont des saponines st\u00e9ro\u00efdiennes. Les saponines st\u00e9ro\u00efdiennes les plus pr\u00e9sentes dans le Chonglou sont la dioscine et les saponines de spirostanol. La polyphylline I, la polyphylline VI et la polyphylline VII appartiennent toutes \u00e0 la cat\u00e9gorie de la dioscine (figure 1), qui est abondante dans Polygonatum sibiricum et largement utilis\u00e9e dans le traitement de diverses maladies, y compris les effets anti-tumoraux, la r\u00e9gulation immunitaire, les effets antibact\u00e9riens, etc. Les saponines de Zhonglou sont des saponines st\u00e9ro\u00efdes spiral\u00e9es ; les saponines sont compos\u00e9es d'aglycones et de sucres, d'acides glucuroniques ou d'autres acides organiques. Elles contiennent un noyau parent commun dans leur structure (figure 1), qui consiste en six anneaux et 27 atomes de carbone, A, B, C et D \u00e9tant des noyaux parents st\u00e9ro\u00efdiens (cyclopentane dihydroph\u00e9nanthr\u00e8ne). Le noyau st\u00e9ro\u00efde est reli\u00e9 \u00e0 un anneau furanique E et \u00e0 un anneau pyranique F. Il est souvent reli\u00e9 sous la forme d'un spirok\u00e9tide. Dans cet article, la m\u00e9thode d'ancrage mol\u00e9culaire a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9e pour explorer les compos\u00e9s actifs de la plante m\u00e9dicinale chinoise Yizhihua Aesculus pour le traitement du nouveau coronavirus SARS-CoV-2. Le SARS-CoV-2 se lie principalement au r\u00e9cepteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) \u00e0 la surface des cellules humaines par l'interm\u00e9diaire de sa prot\u00e9ine S. Cette \u00e9tude a pr\u00e9dit l'affinit\u00e9 de la liaison avec le r\u00e9cepteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2. Cette \u00e9tude a pr\u00e9dit l'affinit\u00e9 de liaison de trois types de saponines (I, VI, VII) riches en Polygonatum sibiricum avec l'ACE2 par le biais d'une simulation d'amarrage mol\u00e9culaire.<\/p>\n
Le SRAS-CoV-2 \u00e9tant un virus r\u00e9cemment d\u00e9couvert, il n'existe actuellement aucun m\u00e9dicament sp\u00e9cifique confirm\u00e9 ou disponible. La strat\u00e9gie de traitement \u00e9conomiquement efficace consiste \u00e0 utiliser les m\u00e9dicaments existants. Le traitement clinique a montr\u00e9 que la combinaison de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise et de la m\u00e9decine occidentale a des effets th\u00e9rapeutiques significatifs sur le COVID-19. Par cons\u00e9quent, l'examen des m\u00e9dicaments existants extraits de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise est une strat\u00e9gie efficace. Des \u00e9tudes ant\u00e9rieures ont montr\u00e9 que la chloroquine est tr\u00e8s efficace pour lutter contre l'infection par le SRAS-CoV-2 in vitro. La chloroquine est une 4-aminoquinol\u00e9ine qui, en plus d'\u00eatre principalement utilis\u00e9e comme m\u00e9dicament antipaludique, peut \u00e9galement inhiber la r\u00e9plication virale en r\u00e9duisant la glycosylation terminale des r\u00e9cepteurs ACE2 et en interf\u00e9rant avec la liaison du SARS-CoV-2 aux r\u00e9cepteurs ACE2. Cheng et al. ont utilis\u00e9 l'ancrage mol\u00e9culaire pour calculer l'\u00e9nergie de liaison entre la chloroquine et l'ACE2. Les r\u00e9sultats ont montr\u00e9 que la chloroquine a une capacit\u00e9 de liaison potentielle avec l'ACE2, avec une \u00e9nergie libre de liaison de -5,70 kcal\/mol et des sites de liaison de Leu-95, Gln-58 et Gln-102. Par rapport \u00e0 la chloroquine, les \u00e9nergies libres de liaison des trois saponines avec l'ACE2 sont plus faibles. R\u00e9cemment, avec la propagation mondiale de l'infection par le SRAS-CoV-2, de plus en plus de chercheurs ont \u00e9t\u00e9 impliqu\u00e9s dans le criblage de m\u00e9dicaments contre le SRAS-CoV-2. Yan et al. ont cribl\u00e9 38 m\u00e9dicaments chinois brevet\u00e9s pour l'ECA (PDB : 1R4L) et la principale prot\u00e9ase M du virus (PDB : 6LU7) par docking mol\u00e9culaire, et ont d\u00e9couvert 10 m\u00e9dicaments potentiels contre le SRAS-CoV-2, dont l'art\u00e9misinine, la rutine, la glycyrrhizine, la pu\u00e9rarine, l'andrographolide et la matrine. Liu et al. ont d\u00e9couvert, gr\u00e2ce \u00e0 des \u00e9tudes de pharmacologie de r\u00e9seau et d'ancrage mol\u00e9culaire, que la lut\u00e9oline (-26,78 kJ\/mol), la querc\u00e9tine (-26,36 kJ\/mol) et l'icariine d\u00e9m\u00e9thyl\u00e9e (-25,94 kJ\/mol) se lient \u00e0 l'hydrolase 3CL du SRAS-CoV-2. Certains m\u00e9dicaments peuvent avoir une activit\u00e9 d'ancrage plus faible avec l'ACE2, mais cela ne signifie pas qu'ils ne conviennent pas au traitement par COVID-19, car les simulations d'ancrage ne fournissent qu'une r\u00e9f\u00e9rence pour la recherche pr\u00e9liminaire. En outre, les principes de formulation des prescriptions de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise comprennent l'\u00e9limination de l'invasion pathog\u00e8ne et l'am\u00e9lioration de la r\u00e9sistance de l'organisme. Nous ne pouvons donc pas exclure la possibilit\u00e9 que certains m\u00e9dicaments aient un effet sur COVID-19 en r\u00e9gulant le syst\u00e8me immunitaire. D'autres exp\u00e9riences sont n\u00e9cessaires pour v\u00e9rifier si ces saponines st\u00e9ro\u00efdiennes peuvent cibler l'ACE2 et pr\u00e9venir l'infection par le SRAS-CoV-2 dans des mod\u00e8les de culture cellulaire et chez des animaux de laboratoire.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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