\u00c9tude bioinformatique du pronostic clinique du cancer du foie et th\u00e9rapie cibl\u00e9e par la m\u00e9decine traditionnelle chinoise bas\u00e9e sur le d\u00e9pistage des g\u00e8nes pathog\u00e8nes cl\u00e9s
\nLe cancer primitif du foie est la troisi\u00e8me cause de d\u00e9c\u00e8s li\u00e9s au cancer dans le monde, et le carcinome h\u00e9patocellulaire (CHC) est le type le plus courant de cancer primitif du foie. Ses facteurs de risque comprennent principalement l'infection par le virus de l'h\u00e9patite B (VHB)\/virus de l'h\u00e9patite C (VHC), la consommation excessive d'alcool \u00e0 long terme, la consommation d'aliments contamin\u00e9s par Aspergillus flavus, la cirrhose du foie caus\u00e9e par diverses raisons et les ant\u00e9c\u00e9dents familiaux de carcinome h\u00e9patocellulaire. Le diagnostic pr\u00e9coce du carcinome h\u00e9patocellulaire repose souvent sur les biomarqueurs, qui sont largement utilis\u00e9s dans la pratique clinique. Les biomarqueurs proviennent principalement du s\u00e9rum, du plasma, des microARN pr\u00e9sents dans les tissus, des g\u00e8nes mut\u00e9s, des prot\u00e9ines, etc. De nombreux patients chez qui l'on a diagnostiqu\u00e9 un cancer du foie sont g\u00e9n\u00e9ralement \u00e0 un stade avanc\u00e9 non r\u00e9s\u00e9cable. Apr\u00e8s un traitement palliatif, la dur\u00e9e m\u00e9diane de survie n'est que de 6 \u00e0 12 mois, et le taux de survie \u00e0 5 ans n'est que de 10%. Par cons\u00e9quent, le criblage des g\u00e8nes pathog\u00e8nes cl\u00e9s du cancer du foie rev\u00eat une importance clinique consid\u00e9rable pour le diagnostic pr\u00e9coce et l'analyse du pronostic du cancer du foie chez les patients atteints de cette maladie.<\/p>\n
Le d\u00e9veloppement rapide de la technologie de s\u00e9quen\u00e7age \u00e0 haut d\u00e9bit a modifi\u00e9 le mode de recherche de la science biom\u00e9dicale. Le s\u00e9quen\u00e7age des g\u00e8nes permet de mieux comprendre les questions de biologie tumorale, telles que la pathogen\u00e8se des tumeurs, et a une valeur de r\u00e9f\u00e9rence importante pour le diagnostic, le pronostic et le choix du traitement des tumeurs. Les algorithmes bioinformatiques sont essentiels pour traiter les donn\u00e9es omiques \u00e0 haut d\u00e9bit. Cette \u00e9tude prend comme point de d\u00e9part l'exploration des donn\u00e9es des puces \u00e0 ADN \u00e0 haut d\u00e9bit, introduit la connaissance des algorithmes bioinformatiques, obtient des ensembles de donn\u00e9es li\u00e9s au cancer du foie \u00e0 partir de la base de donn\u00e9es GEO et analyse les g\u00e8nes diff\u00e9rentiellement exprim\u00e9s entre les tissus canc\u00e9reux du foie et les tissus h\u00e9patiques normaux. Le d\u00e9pistage des g\u00e8nes pathog\u00e8nes cl\u00e9s du cancer du foie \u00e0 partir des g\u00e8nes exprim\u00e9s de mani\u00e8re diff\u00e9rentielle, l'exploration des fonctions biologiques des g\u00e8nes cl\u00e9s et leur implication dans les voies de signalisation, les mutations, l'infiltration immunitaire et leur impact sur le pronostic clinique, ainsi que le d\u00e9pistage des m\u00e9dicaments traditionnels chinois potentiels pour le traitement du cancer du foie, visent \u00e0 fournir une r\u00e9f\u00e9rence th\u00e9orique et une base scientifique pour le diagnostic clinique, le traitement et l'\u00e9valuation du pronostic du cancer du foie.<\/p>\n
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Le cancer du foie est l'un des cancers les plus r\u00e9pandus dans le monde, avec environ 840000 personnes qui en souffrent chaque ann\u00e9e et au moins 780000 d\u00e9c\u00e8s qui lui sont imputables. La Chine est un grand pays touch\u00e9 par l'h\u00e9patite. L'augmentation du taux d'incidence de l'h\u00e9patite a fait cro\u00eetre le nombre de patients atteints de cancer du foie. Environ 50% des patients atteints de cancer du foie dans le monde viennent de Chine. \u00c0 l'heure actuelle, le traitement du cancer du foie au stade pr\u00e9coce comprend principalement la r\u00e9section chirurgicale, l'ablation par radiofr\u00e9quence et la transplantation du foie. Au stade interm\u00e9diaire, une combinaison de diverses m\u00e9thodes telles que la chirurgie, l'ablation par radiofr\u00e9quence, la th\u00e9rapie cibl\u00e9e, l'immunoth\u00e9rapie et la chimioth\u00e9rapie est g\u00e9n\u00e9ralement utilis\u00e9e. Le cancer du foie est une tumeur maligne dont le taux de r\u00e9cidive est tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9. Avec des m\u00e9thodes de traitement radicales telles que la r\u00e9section chirurgicale, le taux de r\u00e9cidive dans les 5 ans est toujours aussi \u00e9lev\u00e9 que 77%. Par cons\u00e9quent, un traitement clinique combinant la m\u00e9decine traditionnelle chinoise et occidentale et la m\u00e9decine traditionnelle chinoise peut \u00eatre envisag\u00e9. La m\u00e9decine traditionnelle chinoise n'a pas de terme sp\u00e9cifique pour le cancer du foie. Sur la base de ses sympt\u00f4mes, il est souvent class\u00e9 dans une cat\u00e9gorie de maladie telle que \"diff\u00e9renciation de syndrome\", \"accumulation de foie\", \"jaunisse\" et \"gonflement\". Le traitement du cancer du foie par la m\u00e9decine traditionnelle chinoise comprend le traitement de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise compos\u00e9e, le traitement de la m\u00e9decine chinoise unitaire\/des m\u00e9dicaments traditionnels chinois brevet\u00e9s et des pr\u00e9parations simples, ainsi que le traitement externe tel que l'acupuncture, la moxibustion et l'application d'acupoints. La combinaison de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise et de la m\u00e9decine occidentale comprend principalement la m\u00e9decine traditionnelle chinoise combin\u00e9e au traitement chirurgical, la m\u00e9decine traditionnelle chinoise combin\u00e9e \u00e0 l'ablation par radiofr\u00e9quence, la m\u00e9decine traditionnelle chinoise combin\u00e9e \u00e0 la th\u00e9rapie cibl\u00e9e et la m\u00e9decine traditionnelle chinoise combin\u00e9e \u00e0 la chimioth\u00e9rapie, afin de r\u00e9duire les complications, d'att\u00e9nuer les effets secondaires et de retarder la r\u00e9currence de la tumeur et la formation de m\u00e9tastases. Cet article analyse l'ensemble des donn\u00e9es de la puce du cancer du foie au niveau du m\u00e9canisme mol\u00e9culaire en utilisant les connaissances li\u00e9es \u00e0 la bioinformatique, en extrayant ses g\u00e8nes cl\u00e9s pathog\u00e8nes et en analysant l'importance des g\u00e8nes cl\u00e9s dans le pronostic du cancer du foie. En outre, les m\u00e9dicaments traditionnels chinois potentiels pour le traitement du cancer du foie sont examin\u00e9s par le biais d'un d\u00e9pistage des g\u00e8nes cl\u00e9s. Cette \u00e9tude vise \u00e0 fournir une base scientifique et une r\u00e9f\u00e9rence pour le diagnostic diff\u00e9rentiel, le pronostic et le traitement du cancer du foie.<\/p>\n
L'analyse fonctionnelle GO et l'analyse d'enrichissement des voies KEGG ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que les g\u00e8nes diff\u00e9rentiellement exprim\u00e9s sont principalement impliqu\u00e9s dans des processus biologiques tels que la r\u00e9ponse immunitaire, la r\u00e9ponse inflammatoire et l'adh\u00e9sion cellulaire, impliquant des voies de signalisation telles que p53, mTOR, ErbB, etc. La recherche a montr\u00e9 que la r\u00e9action entre l'antig\u00e8ne du testicule de la tumeur et la prot\u00e9ine Sal like 4 avec des cellules T sp\u00e9cifiques peut jouer un r\u00f4le important dans le contr\u00f4le du cancer du foie \u00e0 un stade pr\u00e9coce ; la suppression du domaine d'oligom\u00e9risation de liaison du nucl\u00e9otide 2 dans le foie peut induire l'apparition du cancer du foie par l'inflammation, les dommages \u00e0 l'ADN et l'instabilit\u00e9 g\u00e9nomique ; l'interf\u00e9ron \u03b3 d\u00e9riv\u00e9 des cellules NK peut favoriser l'apparition du cancer du foie par le processus de transition \u00e9pith\u00e9lio-m\u00e9senchymateuse de la mol\u00e9cule d'adh\u00e9sion cellulaire chez les souris transg\u00e9niques du VHB ; En outre, des \u00e9tudes ont montr\u00e9 que le miR-621 peut am\u00e9liorer la radiosensibilit\u00e9 des cellules canc\u00e9reuses du foie en activant la voie de signalisation p53 ; la sous-unit\u00e9 4 de l'activit\u00e9 du prot\u00e9asome, fortement exprim\u00e9e, peut favoriser la prolif\u00e9ration des cellules canc\u00e9reuses du foie par la voie de signalisation mTOR ; l'antig\u00e8ne 1 de type V \u00e9pith\u00e9lial peut r\u00e9guler \u00e0 la hausse la voie de signalisation ErbB3-PI3K, ce qui favorise la progression et les m\u00e9tastases du cancer du foie.<\/p>\n
L'analyse des interactions prot\u00e9iques a identifi\u00e9 10 g\u00e8nes cl\u00e9s fortement exprim\u00e9s dans les tissus du cancer du foie, \u00e0 savoir CDC20 CCNB2\u3001CCNB1\u3001BUB1\u3001BIRC5\u3001AURKA\u3001TOP2A\u3001NCAPH\u3001CDK1\u3002 L'analyse pronostique de ces 10 g\u00e8nes cl\u00e9s a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que le groupe d'expression \u00e9lev\u00e9e des g\u00e8nes cl\u00e9s r\u00e9duisait significativement la survie globale des patients atteints de cancer du foie, et que ces g\u00e8nes cl\u00e9s \u00e9taient positivement corr\u00e9l\u00e9s avec les r\u00e9sultats de l'analyse pathologique du cancer du foie. La recherche a montr\u00e9 que l'expression de CDC20 dans les tissus du cancer du foie est plus \u00e9lev\u00e9e que dans les tissus normaux (P<0,05), et que les patients atteints de cancer du foie ayant une forte expression de CDC20 ont un taux de survie globale plus faible ; la recherche a montr\u00e9 que les patients atteints de cancer du foie ayant des niveaux \u00e9lev\u00e9s de CCNB2 ont une survie globale \u00e0 5 ans et une survie sans maladie plus courtes que ceux ayant des niveaux faibles de CCNB2 ; d'autres \u00e9tudes ont montr\u00e9 que des niveaux plus \u00e9lev\u00e9s de BUB1B peuvent \u00eatre d\u00e9tect\u00e9s dans les tissus du cancer du foie, et que la surexpression de BUB1B est positivement corr\u00e9l\u00e9e avec des manifestations cliniques et pathologiques d\u00e9favorables.<\/p>\n
La validation de l'expression et l'analyse des mutations de 10 g\u00e8nes cl\u00e9s ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 qu'ils \u00e9taient fortement exprim\u00e9s dans les tissus du cancer du foie, les niveaux d'expression des prot\u00e9ines de CDC20, CCNB1, TOP2A et NCAPH augmentant \u00e0 des degr\u00e9s divers dans les tissus du cancer du foie ; en outre, il existe un certain degr\u00e9 de mutation des g\u00e8nes cl\u00e9s dans les tissus du cancer du foie, et les patients atteints de cancer du foie porteurs de ce g\u00e8ne cl\u00e9 mut\u00e9 ont un pronostic plus d\u00e9favorable. L'analyse de l'infiltration des cellules immunitaires par les g\u00e8nes cl\u00e9s a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que l'expression des g\u00e8nes cl\u00e9s est positivement corr\u00e9l\u00e9e au degr\u00e9 d'infiltration des cellules B, des cellules CD8+T, des cellules CD4+T, des macrophages, des neutrophiles et des cellules dendritiques. Yang Gang et al. ont utilis\u00e9 l'immunohistochimie pour d\u00e9tecter le niveau d'expression prot\u00e9ique des CDC20 dans les tissus du cancer du foie, et les r\u00e9sultats ont montr\u00e9 qu'une forte expression des CDC20 \u00e9tait observ\u00e9e dans 59,2% des \u00e9chantillons de carcinome h\u00e9patocellulaire. Rong Min Hua et al. ont d\u00e9couvert que l'ARNm et la prot\u00e9ine CCNB1 sont surexprim\u00e9s dans les tissus de carcinome h\u00e9patocellulaire, et que CCNB1 peut participer au cycle cellulaire du CHC en r\u00e9gulant la r\u00e9plication de l'ADN. Ces r\u00e9sultats indiquent que les r\u00e9sultats pr\u00e9dits dans cet article sont fiables et pr\u00e9cis.<\/p>\n
Les r\u00e9sultats du criblage de m\u00e9dicaments th\u00e9rapeutiques potentiels ont r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que CCNB1, BIRC5, CDK1 et CDC20 ont cribl\u00e9 un grand nombre de m\u00e9dicaments traditionnels chinois, et que CDK1, CCNB1, BIRC5 et TOP2A ont li\u00e9 un grand nombre d'ingr\u00e9dients th\u00e9rapeutiques naturels potentiels. CDK1, CCNB1 et BIRC5 pourraient \u00eatre des cibles universelles pour la pharmacoth\u00e9rapie. L'Artemisia annua, le galanga et l'herbe d'hiver peuvent agir sur 2 ou 3 g\u00e8nes cl\u00e9s et sont des m\u00e9dicaments traditionnels chinois potentiels pour le traitement du cancer du foie. La recherche a montr\u00e9 que l'art\u00e9misinine, l'ingr\u00e9dient actif de l'Artemisia annua, peut r\u00e9guler la prolif\u00e9ration, l'apoptose et l'angiogen\u00e8se des cellules canc\u00e9reuses du foie par le biais de diverses voies telles que l'EGFR ; l'ingr\u00e9dient efficace du galanga est la galangine, qui peut pr\u00e9venir le carcinome h\u00e9patocellulaire par le biais du stress du r\u00e9ticulum endoplasmique et de l'apoptose d\u00e9pendante des mitochondries ; l'herbe d'hiver peut am\u00e9liorer la sensibilit\u00e9 du cancer du foie aux effets anticanc\u00e9reux du sorafenib en ciblant la voie AKT. Selon la th\u00e9orie de la m\u00e9decine traditionnelle chinoise, la pathogen\u00e8se principale du carcinome h\u00e9patocellulaire est la \"stase sanguine\", la \"toxicit\u00e9\" et la \"carence\". La m\u00e9decine traditionnelle chinoise joue un r\u00f4le dans le soutien de l'organisme, l'\u00e9limination du mal, l'attaque des toxines et la lutte contre le cancer au niveau mol\u00e9culaire, en parvenant \u00e0 un \u00e9tat d'\u00e9quilibre entre le yin et le yang dans l'organisme. Par rapport au traitement traditionnel occidental, la m\u00e9decine traditionnelle chinoise pr\u00e9sente des avantages potentiels dans le traitement du carcinome h\u00e9patocellulaire, qui se traduisent par de faibles effets secondaires, une faible incidence d'effets ind\u00e9sirables, une croissance tumorale ralentie, une r\u00e9duction des r\u00e9cidives et des m\u00e9tastases, une am\u00e9lioration de la qualit\u00e9 de vie des patients et une prolongation du cycle de survie.<\/p>\n
En r\u00e9sum\u00e9, cette \u00e9tude a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que l'apparition et le d\u00e9veloppement du cancer du foie pr\u00e9sentent les caract\u00e9ristiques de plusieurs g\u00e8nes, voies et fonctions. Les niveaux d'expression de ces g\u00e8nes et de leurs produits prot\u00e9iques sont \u00e9lev\u00e9s chez les patients atteints de cancer du foie et sont \u00e9troitement li\u00e9s au mauvais pronostic du cancer du foie et au degr\u00e9 d'infiltration des cellules immunitaires. Une exploration plus pouss\u00e9e a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 36 m\u00e9dicaments traditionnels chinois potentiels pour le traitement cibl\u00e9 du cancer du foie, y compris l'artemisia annua, le galanga et l'herbe d'hiver, ainsi que 105 ingr\u00e9dients actifs naturels. Les r\u00e9sultats de recherche de cet article peuvent fournir une base scientifique pour le diagnostic clinique, l'\u00e9valuation du pronostic et le traitement connexe du cancer du foie.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Bioinformatics study on clinical prognosis of liver cancer and targeted therapy with traditional Chinese medicine based on screening of key pathogenic genes Primary liver cancer is the third leading cause of cancer-related deaths worldwide, and hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common type of primary liver cancer. Its risk factors mainly include hepatitis B virus […]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n