Bioinformatisk unders\u00f8gelse af klinisk prognose for leverkr\u00e6ft og m\u00e5lrettet behandling med traditionel kinesisk medicin baseret p\u00e5 screening af vigtige patogene gener
\nPrim\u00e6r leverkr\u00e6ft er den tredjest\u00f8rste \u00e5rsag til kr\u00e6ftrelaterede d\u00f8dsfald p\u00e5 verdensplan, og hepatocellul\u00e6rt karcinom (HCC) er den mest almindelige form for prim\u00e6r leverkr\u00e6ft. Risikofaktorerne omfatter hovedsageligt hepatitis B virus (HBV)\/hepatitis C virus (HCV)-infektion, langvarig overdreven alkoholindtagelse, indtagelse af f\u00f8devarer forurenet med Aspergillus flavus, levercirrhose for\u00e5rsaget af forskellige \u00e5rsager og en familiehistorie med hepatocellul\u00e6rt karcinom. Tidlig diagnose af hepatocellul\u00e6rt karcinom er ofte afh\u00e6ngig af biomark\u00f8rer, som anvendes i vid udstr\u00e6kning i klinisk praksis. Biomark\u00f8rer kommer hovedsageligt fra serum, plasma, mikroRNA'er i v\u00e6v, muterede gener, proteiner osv. Mange patienter, der diagnosticeres med leverkr\u00e6ft, er normalt i det sene inoperable stadie. Efter palliativ behandling er den mediane overlevelsestid kun 6-12 m\u00e5neder, og den 5-\u00e5rige overlevelsesrate er kun 10%. Derfor har screening af vigtige patogene gener for leverkr\u00e6ft vigtig klinisk betydning for tidlig diagnose og analyse af prognosen for leverkr\u00e6ft hos patienter med leverkr\u00e6ft.<\/p>\n
Den hurtige udvikling af high-throughput-sekventeringsteknologi har \u00e6ndret forskningsmetoden inden for biomedicinsk videnskab. Gensekventering giver en ny forst\u00e5else af tumorbiologiske sp\u00f8rgsm\u00e5l som f.eks. tumorernes patogenese og har en vigtig referencev\u00e6rdi for diagnose, prognose og valg af behandling af tumorer. Bioinformatiske algoritmer er afg\u00f8rende for behandlingen af omics-data med h\u00f8j kapacitet. Denne unders\u00f8gelse tager udgangspunkt i high-throughput gene chip data mining, introducerer viden om bioinformatiske algoritmer, indhenter leverkr\u00e6ftrelaterede datas\u00e6t fra GEO-databasen og analyserer forskelligt udtrykte gener mellem leverkr\u00e6ftv\u00e6v og normalt leverv\u00e6v. Yderligere screening af vigtige patogene gener af leverkr\u00e6ft fra differentielt udtrykte gener, udforskning af de biologiske funktioner af n\u00f8glegener og deres involvering i signalveje, mutationer, immuninfiltration og deres indvirkning p\u00e5 klinisk prognose og yderligere screening af potentielle traditionelle kinesiske l\u00e6gemidler til behandling af leverkr\u00e6ft med det form\u00e5l at give teoretisk reference og videnskabeligt grundlag for den kliniske diagnose, behandling og prognosed\u00f8mmelse af leverkr\u00e6ft.<\/p>\n
<\/p>\n
Leverkr\u00e6ft er en af de mest almindelige kr\u00e6ftformer p\u00e5 verdensplan, hvor ca. 840000 mennesker lider af det hvert \u00e5r, og mindst 780000 d\u00f8r af det. Kina er et stort land med hepatitis. Stigningen i forekomsten af hepatitis har \u00f8get antallet af leverkr\u00e6ftpatienter. Omkring 50% af alle leverkr\u00e6ftpatienter i verden kommer fra Kina. P\u00e5 nuv\u00e6rende tidspunkt omfatter behandlingen af tidlig leverkr\u00e6ft hovedsageligt kirurgisk resektion, radiofrekvensablation og levertransplantation. I mellemstadiet anvendes normalt en kombination af forskellige metoder som kirurgi, radiofrekvensablation, m\u00e5lrettet terapi, immunterapi og kemoterapi; i det sene stadie anvendes for det meste underst\u00f8ttende behandling. Leverkr\u00e6ft er en ondartet tumor med en meget h\u00f8j tilbagefaldsrate. Med radikale behandlingsmetoder som kirurgisk resektion er tilbagefaldshastigheden inden for 5 \u00e5r stadig s\u00e5 h\u00f8j som 77%. Derfor kan klinisk behandling med en kombination af traditionel kinesisk og vestlig medicin og traditionel kinesisk medicin overvejes. Traditionel kinesisk medicin har ikke et specifikt udtryk for leverkr\u00e6ft. Baseret p\u00e5 dens symptomer klassificeres den ofte som en sygdomskategori s\u00e5som \"syndromdifferentiering\", \"leverakkumulering\", \"gulsot\" og \"h\u00e6velse\". Behandlingen af leverkr\u00e6ft med traditionel kinesisk medicin inkluderer behandling af traditionel kinesisk medicinforbindelse, behandling af enhedskinesisk medicin \/ traditionel kinesisk patentmedicin og enkle pr\u00e6parater samt ekstern behandling s\u00e5som akupunktur og moxibustion og acupoint-applikation; Kombinationen af traditionel kinesisk medicin og vestlig medicin inkluderer hovedsageligt traditionel kinesisk medicin kombineret med kirurgisk behandling, traditionel kinesisk medicin kombineret med radiofrekvensablation, traditionel kinesisk medicin kombineret med m\u00e5lrettet terapi og traditionel kinesisk medicin kombineret med kemoterapi for at reducere komplikationer, lindre bivirkninger og forsinke tumorrecidiv og metastase. Denne artikel analyserer chipdatas\u00e6ttet med leverkr\u00e6ft fra det molekyl\u00e6re mekanismeniveau ved at bruge bioinformatik-relateret viden, udvinde dets patogene n\u00f8glegener og analysere betydningen af n\u00f8glegener i prognosen for leverkr\u00e6ft. Desuden screenes potentielle traditionelle kinesiske l\u00e6gemidler til behandling af leverkr\u00e6ft gennem screening af n\u00f8glegener. Denne unders\u00f8gelse har til form\u00e5l at skabe et videnskabeligt grundlag og en reference for differentialdiagnose, prognose og behandling af leverkr\u00e6ft.<\/p>\n
GO-funktionel og KEGG-vejberigelsesanalyse afsl\u00f8rede, at forskelligt udtrykte gener hovedsageligt er involveret i biologiske processer s\u00e5som immunrespons, inflammatorisk respons og celleadh\u00e6sion, der involverer signalveje, herunder p53, mTOR, ErbB osv. Forskning har vist, at reaktionen mellem tumor testis antigen og Sal som protein 4 med specifikke T-celler kan spille en vigtig rolle i kontrollen af tidlig leverkr\u00e6ft; Sletning af nukleotid de bindende oligomeriseringsdom\u00e6ne 2 i leveren kan inducere forekomsten af leverkr\u00e6ft gennem bet\u00e6ndelse, DNA-skade og genomisk ustabilitet; Interferon - \u03b3 afledt af NK-celler kan fremme forekomsten af leverkr\u00e6ft gennem epitelcelleadh\u00e6sionsmolekylets epiteliale mesenchymale overgangsproces i HBV-transgene mus; Derudover har unders\u00f8gelser vist, at miR-621 kan forbedre str\u00e5lef\u00f8lsomheden hos leverkr\u00e6ftceller ved at aktivere p53-signalvejen; Den st\u00e6rkt udtrykte proteasomaktivitetsunderenhed 4 kan fremme spredning af leverkr\u00e6ftceller gennem mTOR-signalvejen; Epithelial V-lignende antigen 1 kan opregulere ErbB3-PI3K-signalvejen og derved fremme progression og metastase af leverkr\u00e6ft.<\/p>\n
Proteininteraktionsanalyse identificerede 10 n\u00f8glegener, der var st\u00e6rkt udtrykt i leverkr\u00e6ftv\u00e6v, nemlig CDC20 CCNB2\u3001CCNB1\u3001BUB1\u3001BIRC5\u3001AURKA\u3001TOP2A\u3001NCAPH\u3001CDK1\u3002 Prognostisk analyse af disse 10 n\u00f8glegener afsl\u00f8rede, at den h\u00f8je ekspressionsgruppe af n\u00f8glegener signifikant reducerede den samlede overlevelse af leverkr\u00e6ftpatienter, og disse n\u00f8glegener var positivt korreleret med de patologiske analyseresultater af leverkr\u00e6ft. Forskning har vist, at udtrykket af CDC20 i leverkr\u00e6ftv\u00e6v er h\u00f8jere end i normalt v\u00e6v (P<0,05), og leverkr\u00e6ftpatienter med h\u00f8jt udtryk for CDC20 har en lavere samlet overlevelsesrate; Forskning har vist, at leverkr\u00e6ftpatienter med h\u00f8je niveauer af CCNB2 har kortere 5-\u00e5rig samlet overlevelse og sygdomsfri overlevelse sammenlignet med dem med lave niveauer af CCNB2; Andre unders\u00f8gelser har vist, at h\u00f8jere niveauer af BUB1B kan p\u00e5vises i leverkr\u00e6ftv\u00e6v, og overekspression af BUB1B er positivt korreleret med negative kliniske og patologiske manifestationer.<\/p>\n
Yderligere ekspressionsvalidering og mutationsanalyse af 10 n\u00f8glegener afsl\u00f8rede, at de blev st\u00e6rkt udtrykt i leverkr\u00e6ftv\u00e6v, hvor proteinekspressionsniveauerne af CDC20, CCNB1, TOP2A og NCAPH steg i varierende grad i leverkr\u00e6ftv\u00e6v; Derudover er der en vis grad af mutation i n\u00f8glegener i leverkr\u00e6ftv\u00e6v, og leverkr\u00e6ftpatienter, der b\u00e6rer dette muterede n\u00f8glegen, har en d\u00e5rligere prognose. Immuncelleinfiltrationsanalysen af n\u00f8glegener fandt, at udtrykket af n\u00f8glegener er positivt korreleret med graden af infiltration af B-celler, CD8 + T-celler, CD4 + T-celler, makrofager, neutrofiler og dendritiske celler. Yang Gang et al. brugte immunhistokemi til at p\u00e5vise proteinekspressionsniveauet af CDC20 i leverkr\u00e6ftv\u00e6v, og resultaterne viste, at h\u00f8j ekspression af CDC20 blev observeret i 59,2% af hepatocellul\u00e6re karcinom-pr\u00f8ver. Rong Min Hua et al. fandt, at mRNA og protein fra CCNB1 er overudtrykt i hepatocellul\u00e6rt karcinomv\u00e6v, og CCNB1 kan deltage i HCC's cellecyklus ved at regulere DNA-replikation. Disse resultater indikerer, at de forudsagte resultater i denne artikel har god p\u00e5lidelighed og n\u00f8jagtighed.<\/p>\n
Screeningsresultaterne af potentielle terapeutiske l\u00e6gemidler viste, at CCNB1, BIRC5, CDK1 og CDC20 screenede et stort antal traditionelle kinesiske l\u00e6gemidler, og CDK1, CCNB1, BIRC5 og TOP2A bandt et stort antal potentielle naturlige terapeutiske ingredienser. CDK1, CCNB1 og BIRC5 kan v\u00e6re universelle m\u00e5l for l\u00e6gemiddelterapi. Artemisia annua, galangal og vintergr\u00e6s kan virke p\u00e5 2-3 n\u00f8glegener og er potentielle traditionelle kinesiske l\u00e6gemidler til behandling af leverkr\u00e6ft. Forskning har vist, at artemisinin er den aktive ingrediens i Artemisia annua, som kan regulere spredning, apoptose og angiogenese af leverkr\u00e6ftceller gennem forskellige veje som EGFR; Den effektive ingrediens i galangal er galangin, som kan forhindre hepatocellul\u00e6rt karcinom gennem endoplasmatisk retikulumstress og mitokondrieafh\u00e6ngig apoptose; Vintergr\u00e6s kan \u00f8ge f\u00f8lsomheden af leverkr\u00e6ft over for sorafenib anticancereffekter ved at m\u00e5lrette AKT-vejen. If\u00f8lge traditionel kinesisk medicinteori er den vigtigste patogenese af hepatocellul\u00e6rt karcinom \"blodstasis\", \"toksicitet\" og \"mangel\". Traditionel kinesisk medicin spiller en rolle i at st\u00f8tte kroppen, eliminere det onde, angribe toksiner og bek\u00e6mpe kr\u00e6ft p\u00e5 molekyl\u00e6rt niveau og opn\u00e5 en tilstand af balance mellem yin og yang i kroppen. Sammenlignet med traditionel vestlig medicinbehandling har traditionel kinesisk medicin potentielle fordele i behandlingen af hepatocellul\u00e6rt karcinom, hvilket afspejles i de sm\u00e5 bivirkninger, lav forekomst af bivirkninger, langsom tumorv\u00e6kst, reduceret tilbagefald og metastase, forbedret livskvalitet for patienter og forl\u00e6nget overlevelsescyklus.<\/p>\n
Sammenfattende fandt denne unders\u00f8gelse, at forekomsten og udviklingen af leverkr\u00e6ft har karakteristika for flere gener, veje og funktioner. I alt 10 n\u00f8glegener til patogenese af leverkr\u00e6ft blev screenet og opn\u00e5et; Ekspressionsniveauerne for disse gener og deres proteinprodukter er forh\u00f8jede hos leverkr\u00e6ftpatienter og er t\u00e6t forbundet med den d\u00e5rlige prognose for leverkr\u00e6ft og graden af immuncelleinfiltration; Yderligere udforskning afsl\u00f8rede 36 potentielle traditionelle kinesiske l\u00e6gemidler til m\u00e5lrettet behandling af leverkr\u00e6ft, herunder artemisia annua, galangal og vintergr\u00e6s, samt 105 naturlige aktive ingredienser. Forskningsresultaterne i denne artikel kan give videnskabeligt grundlag for den kliniske diagnose, prognosebed\u00f8mmelse og relateret behandling af leverkr\u00e6ft.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Bioinformatics study on clinical prognosis of liver cancer and targeted therapy with traditional Chinese medicine based on screening of key pathogenic genes Primary liver cancer is the third leading cause of cancer-related deaths worldwide, and hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common type of primary liver cancer. Its risk factors mainly include hepatitis B virus […]<\/p>","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[20],"tags":[],"yoast_head":"\n